データセット ID
JGAD000105
- データの種類
- NGS(RNA-seq)
NGS(Amplicon-seq) - アクセス制限
- 制限公開(Type I)
- 総データ量
- 5.3 MB
- ファイル形式
- TXT
- 研究
- hum0111
- 公開日
- 2020-09-28
- 更新日
- 2020-09-28
- DDBJ Search
- JGAD000105 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000103 (新しいタブで開きます)
解析手法
RNA-seq
- 材料と対象者
- びまん性胃がん(ICD10:C16):30症例(腫瘍組織のみ)
- 健康状態罹患
- 対象者数30 (人数)
- 疾患
- びまん性胃がん
- 試料説明
- 腫瘍組織から抽出したRNA
- 腫瘍 / 非腫瘍腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- RNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- TruSeq Stranded mRNA Library Prep Kit
- 断片化
- N/A
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 100 bp
- 加工データの種類
- FPKM
- 表現型データの有無
- あり