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NBDC Research ID:hum0075-v3
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研究題目

B型肝炎ウイルス感染の病態別における宿主遺伝因子の探索研究

研究概要

目的: B型肝炎ウイルス感染の病態別における宿主遺伝因子の探索

研究方法: 対象1〜3について、Affymetrix Genome-Wide Human SNP Array 6.0を使用して約90万個の一塩基多型 (Single Nucleotide Polymorphisms: SNPs) の遺伝子型を決定後ゲノムワイド関連解析 (Genome-Wide Association Study: GWAS) を実施 対象4および対象5について、Affymetrix Axiom Genome-Wide ASI 1 Arrayを使用して約60万個のSNPsの遺伝子型を決定後GWASを実施

対象: 1． B型肝炎ウイルスキャリア 181症例、および、健常対照者 184名 2． B型肝炎ウイルスキャリア 181症例、および、B型肝炎ウイルス排除群 185症例 3. B型肝炎ウイルス排除群 185症例、および、健常対照者 184名 4. B型肝炎ウイルス陽性肝がん 473症例、および、B型肝炎ウイルスキャリア群 (慢性肝炎および無症候キャリア) 516症例 5. タイ人B型肝炎 (肝がんを併発している患者を含む) 329症例、および、タイ人健常対照者318名

データセット一覧

データセット ID
アクセス制限
データの種類
公開日
hum0075.v1.gwas.v1非制限公開B型肝炎ウイルスキャリア 181症例、および、 健常対照者 184名のGWAS2017-09-25
hum0075.v1.virus.v1非制限公開B型肝炎ウイルスキャリア 181症例、および、 B型肝炎ウイルス排除群 185症例のGWAS2017-09-25
hum0075.v1.clear.v1非制限公開B型肝炎ウイルス排除群 185症例、および、 健常対照者 184名のGWAS2017-09-25
hum0075.v2.hcc.v1非制限公開B型ウイルス陽性肝がん 473症例、および、 B型肝炎ウイルスキャリア群 516症例のGWAS2019-02-19
hum0075.v3.Thai-gwas.v1非制限公開タイ人B型肝炎 329症例、および、 タイ人健常対照者 318名のGWAS2022-05-27

提供者情報

    代表者
    溝上 雅史
    所属機関
    国立国際医療研究センター 肝炎免疫研究センター 肝疾患研究部

研究プロジェクト情報

研究プロジェクト名
URL
ゲノム医科学プロジェクトhttps://www.ncgmkohnodai.go.jp/kanen_meneki/index.html

助成金情報

科研費・助成金名
タイトル
研究課題番号
厚生労働科学研究費補助金ウイルス性肝炎に対する応答性を規定する宿主因子も含めた情報のデータベース構築・治療応用に関する研究
  • H22-kanen-005
厚生労働科学研究費補助金Ｂ型肝炎ウイルス感染の病態別における宿主因子等について、網羅的な遺伝子解析を用い、新規診断法及び治療法の開発を行う研究
  • H23-kanen-005
厚生労働科学研究費補助金ゲノム網羅的解析によるＢ型肝炎ウイルス感染の病態関連遺伝子の同定と新規診断法の開発
  • H26-kanen-004
厚生労働科学研究費補助金B型肝炎の慢性化・ウイルス排除に関連する遺伝要因について、HLAアリルおよび免疫関連遺伝子群を網羅的に探索する研究
  • H25-kanen-012
科学研究費助成事業 若手研究 (B)B型肝炎の慢性化に関連する遺伝要因の探索
  • 25870178
国立研究開発法人日本医療研究開発機構 (AMED) 肝炎等克服実用化研究事業 肝炎等克服緊急対策研究事業B型肝炎ウイルスおよびヒトゲノムの解析に基づくクリニカルシークエンスに向けた研究
  • JP20fk0210056
宮川庚子記念研究財団平成26年度研究助成B型肝炎の慢性化および癌化に関連する遺伝要因の網羅的探索

    関連論文

    タイトル
    DOI
    		データセット
    Genome-Wide Association Study Confirming Association of HLA-DP with Protection against Chronic Hepatitis B and Viral Clearance in Japanese and Koreanhttps://doi.org/10.1371/journal.pone.0039175
    Genome-wide association study identified new susceptible genetic variants in HLA class I region for hepatitis B virus-related hepatocellular carcinomahttps://doi.org/10.1038/s41598-018-26217-7
    Genome-wide association study for chronic hepatitis B infection in the Thai populationhttps://doi.org/10.3389/fgene.2022.887121

    制限公開データの利用者一覧

    名前
    所属機関
    国
    研究題目
    データ利用期間
    		データセット一覧
    データなし