データセット ID
NHA000055
- データの種類
- B型肝炎ウイルスキャリア 181症例、および、
健常対照者 184名のGWAS - アクセス制限
- 非制限公開
- 総データ量
- 22.9 KB
- ファイル形式
- CSV
- XLSX
- 研究
- hum0075
- 公開日
- 2017-09-25
- 更新日
- 2017-09-25
- Secondary ID
- hum0075.v1.gwas.v1
このデータセットに紐づく非制限公開ファイル
| ファイル名 | ラベル | サイズ | URL のコピー |
|---|---|---|---|
| hum0075.v1.gwas.v1.csv | 11.9 KB | ||
| hum0075_ | Dictionary file | 11.0 KB |
解析手法
Genotyping by array
- 材料と対象者
- B型肝炎ウイルスキャリア：181症例
健常対照者：184名 - 健康状態混在
- 対象者数365 (人数)
- 試料説明
- 末梢血から抽出したgDNA
- 組織末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- Genotyping by array
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- Genome-Wide Human SNP Array 6.0 Kit
- プラットフォーム
- Affymetrix Genome-Wide Human SNP Array 6.0
- 参照ゲノム
- NCBI36
- QC・フィルタリング
- Sample call rate < 0.95、SNP call rate < 0.95、HWE P < 0.001
Pearson's chi-square test P < 1.0x10^-4 - 解析方法
- Genotyping Console v4.1 software（Birdseed v1）
- バリアント数
- 104 (常染色体のSNP)