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NBDC ヒトデータベース

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研究 ID

hum0075-v2リリース情報

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最新バージョン (v3)

研究題目

B型肝炎ウイルス感染の病態別における宿主遺伝因子の探索研究

研究概要

目的
B型肝炎ウイルス感染の病態別における宿主遺伝因子の探索
研究方法
対象1〜3について、Affymetrix Genome-Wide Human SNP Array 6.0を使用して約90万個の一塩基多型（Single Nucleotide Polymorphisms：SNPs）の遺伝子型を決定後ゲノムワイド関連解析（Genome-Wide Association Study：GWAS）を実施
対象4および対象5について、Affymetrix Axiom Genome-Wide ASI 1 Arrayを使用して約60万個のSNPsの遺伝子型を決定後GWASを実施
対象
1． B型肝炎ウイルスキャリア 181症例、および、健常対照者 184名
2． B型肝炎ウイルスキャリア 181症例、および、B型肝炎ウイルス排除群 185症例
3. B型肝炎ウイルス排除群 185症例、および、健常対照者 184名
4. B型肝炎ウイルス陽性肝がん 473症例、および、B型肝炎ウイルスキャリア群（慢性肝炎および無症候キャリア） 516症例
5. タイ人B型肝炎（肝がんを併発している患者を含む） 329症例、および、タイ人健常対照者318名
URL
N/A

データセット

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カートデータセット IDデータの種類解析手法アクセス制限公開日
NHA000055B型肝炎ウイルスキャリア 181症例、および、
健常対照者 184名のGWAS
  • Genotyping by array
非制限公開2017-09-25
NHA000056B型肝炎ウイルスキャリア 181症例、および、
B型肝炎ウイルス排除群 185症例のGWAS
  • Genotyping by array
非制限公開2017-09-25
NHA000054B型肝炎ウイルス排除群 185症例、および、
健常対照者 184名のGWAS
  • Genotyping by array
非制限公開2017-09-25
NHA000079B型ウイルス陽性肝がん 473症例、および、
B型肝炎ウイルスキャリア群 516症例のGWAS
  • Genotyping by array
非制限公開2019-02-19

提供者

研究代表者
溝上 雅史
所属機関
国立国際医療研究センター 肝炎免疫研究センター 肝疾患研究部

研究プロジェクト情報

研究プロジェクト名URL
ゲノム医科学プロジェクト

助成金情報

科研費・助成金名研究課題名研究課題番号
厚生労働科学研究費補助金
ウイルス性肝炎に対する応答性を規定する宿主因子も含めた情報のデータベース構築・治療応用に関する研究
  • H22-kanen-005
厚生労働科学研究費補助金
B型肝炎ウイルス感染の病態別における宿主因子等について、網羅的な遺伝子解析を用い、新規診断法及び治療法の開発を行う研究
  • H23-kanen-005
厚生労働科学研究費補助金
ゲノム網羅的解析によるB型肝炎ウイルス感染の病態関連遺伝子の同定と新規診断法の開発
  • H26-kanen-004
厚生労働科学研究費補助金
B型肝炎の慢性化・ウイルス排除に関連する遺伝要因について、HLAアリルおよび免疫関連遺伝子群を網羅的に探索する研究
  • H25-kanen-012
科学研究費助成事業 若手研究（B）
B型肝炎の慢性化に関連する遺伝要因の探索
  • 25870178
国立研究開発法人日本医療研究開発機構（AMED） 肝炎等克服実用化研究事業 肝炎等克服緊急対策研究事業
B型肝炎ウイルスおよびヒトゲノムの解析に基づくクリニカルシークエンスに向けた研究
  • JP20fk0210056
宮川庚子記念研究財団平成26年度研究助成
B型肝炎の慢性化および癌化に関連する遺伝要因の網羅的探索
N/A

関連論文

タイトルDOIデータセット ID
Genome-Wide Association Study Confirming Association of HLA-DP with Protection against Chronic Hepatitis B and Viral Clearance in Japanese and Korean
https://doi.org/10.1371/journal.pone.0039175 (新しいタブで開きます)
Genome-wide association study identified new susceptible genetic variants in HLA class I region for hepatitis B virus-related hepatocellular carcinoma
https://doi.org/10.1038/s41598-018-26217-7 (新しいタブで開きます)
Genome-wide association study for chronic hepatitis B infection in the Thai population
https://doi.org/10.3389/fgene.2022.887121 (新しいタブで開きます)