研究 ID
hum0040-v1リリース情報
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研究題目
生殖発生に関わる細胞のエピゲノム解析基盤研究
研究概要
- 目的
- ヒト胎盤におけるインプリント制御領域およびインプリント遺伝子の同定
- 研究方法
- 母親由来アリルと父親由来方アリルを区別するため、Whole Genome Sequencing （WGS）もしくはWhole Exon sequencing （WES）解析を用い、ヒト胎盤および母体血より一塩基多型情報を取得した。次に、ヒト胎盤サンプルのBisulfite sequencing（BS-seq）解析およびRNA-seq解析を行い、アリル特異的DNAメチル化および遺伝子発現解析を行った。
- 対象
- ヒト胎盤および母体血
- URL
- N/A
データセット
| カート | データセット ID | データの種類 | 解析手法 | アクセス制限 | 公開日 |
|---|---|---|---|---|---|
| JGAD000038 | NGS（WGS） NGS（Exome） NGS（WGBS） NGS（RNA-seq） |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 |
提供者
- 研究代表者
- 有馬 隆博
- 所属機関
- 東北大学大学院 医学系研究科 環境遺伝医学総合研究センター 情報遺伝学分野
研究プロジェクト情報
| 研究プロジェクト名 | URL |
|---|---|
生殖発生にかかわる細胞のエピゲノム解析基盤研究 | N/A |
助成金情報
| 科研費・助成金名 | 研究課題名 | 研究課題番号 |
|---|---|---|
日本医療研究開発機構 革新的先端研究開発支援事業（AMED-CREST） | 生殖発生にかかわる細胞のエピゲノム解析基盤研究 |
|
関連論文
| タイトル | DOI | データセット ID |
|---|---|---|
Allele-specific methylome and transcriptome analysis reveals widespread imprinting in the human placenta | ||
Derivation of Human Trophoblast Stem Cells |
制限公開データの利用者一覧
| 研究代表者 | 所属機関 | 国・州名 | 研究題目 | データ利用期間 | データセット ID |
|---|---|---|---|---|---|
| Martin Hirst | BC Cancer, part of the Provincial Health Services Authority | カナダ (ブリティッシュコロンビア州) | Epigenomic analysis of human samples | 2018-08-06 – 2022-09-05 | |
| Zhigang Xue | School of Medicine and Life Science, Tongji University | 中国 | Mechanism of cell programming and embryo-gamete original disease in human embryo development. | 2018-12-17 – 2021-03-19 | |
| Jonghwan Kim | Department of Molecular Biosciences, University of Texas at Austin | アメリカ合衆国 (テキサス州) | Establishment of human trophoblast stem-like cells derived from human induced pluripotent stem cells for studying human placental development | 2021-05-31 – 2023-07-05 | |
| Gianluca Ursini | Lieber Institute for Brain Development, Johns Hopkins University School of Medicine | アメリカ合衆国 (メリーランド州) | Analysis of the transcriptional profile of Human Trophoblast Stem Cells | 2022-04-26 – 2026-12-31 | |
| 浜田 道昭 | 浜田研究室, 理工学術院, 早稲田大学 | 日本 | RNA標的創薬データベースの構築 | 2023-01-05 – 2027-10-31 | |
| 依馬 正次 | 幹細胞・ヒト疾患モデル研究分野, 滋賀医科大学 動物生命科学研究センター | 日本 | ヒト胎盤からの栄養膜幹細胞の単離と性状解析 | 2024-08-19 – 2026-08-31 |