2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所（NIG）バイオデータ研究拠点（BSI）ライフサイエンス統合データベース部門（DBCLS）」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします
現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです
目的: ヒト胎盤におけるインプリント制御領域およびインプリント遺伝子の同定
研究方法: 母親由来アリルと父親由来方アリルを区別するため、Whole Genome Sequencing (WGS) もしくはWhole Exon sequencing (WES) 解析を用い、ヒト胎盤および母体血より一塩基多型情報を取得した。次に、ヒト胎盤サンプルのBisulfite sequencing (BS-seq) 解析およびRNA-seq解析を行い、アリル特異的DNAメチル化および遺伝子発現解析を行った。
対象: ヒト胎盤および母体血
データセット ID | アクセス制限 | データの種類 | 公開日 | |
|---|---|---|---|---|
| JGAD000038 | 制限公開（Type I） | NGS(WGS) NGS(Exome) NGS(WGBS) NGS(RNA-seq) | 2020-09-28 | |
研究プロジェクト名 | URL |
|---|---|
| 生殖発生にかかわる細胞のエピゲノム解析基盤研究 | |
科研費・助成金名 | タイトル | 研究課題番号 |
|---|---|---|
| 日本医療研究開発機構 革新的先端研究開発支援事業 (AMED-CREST) | 生殖発生にかかわる細胞のエピゲノム解析基盤研究 |
|
タイトル | DOI | 利用データID |
|---|---|---|
| Allele-specific methylome and transcriptome analysis reveals widespread imprinting in the human placenta | https://doi.org/10.1016/j.ajhg.2016.08.021 | |
| Derivation of Human Trophoblast Stem Cells | https://doi.org/10.1016/j.stem.2017.11.004 | |
研究代表者 | 所属機関 | 国・州名 | 研究題目 | データ利用期間 | 利用データID |
|---|---|---|---|---|---|
| 浜田道昭 | Waseda University | Japan | RNA標的創薬データベースの構築 | 2023-01-05—2027-10-31 | |
| Kim Jonghwan | University of Texas at Austin | USA | Establishment of human trophoblast stem-like cells derived from human induced pluripotent stem cells for studying human placental development | 2021-05-31—2023-07-05 | |
| Hirst Martin | BC Cancer, part of the Provincial Health Services Authority | Canada | Epigenomic analysis of human samples | 2018-08-06—2022-09-05 | |
| 依馬正次 | Shiga University of Medical Science, Research Center for Animal Life Science | Japan | ヒト胎盤からの栄養膜幹細胞の単離と性状解析 | 2024-08-19—2026-09-01 | |
| Ursini Gianluca | Lieber Institute for Brain Development | USA | Analysis of the transcriptional profile of Human Trophoblast Stem Cells | 2022-04-26—2026-12-31 | |
| Xue Zhigang | Tongji University | China | Mechanism of cell programming and embryo-gamete original disease in human embryo development. | 2018-12-17—2021-03-19 | |