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NBDC Research ID:hum0030-v5
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研究題目

婦人科臓器に発生する悪性腫瘍の発症に関連する分子生物学的異常の検索

研究概要

目的: 卵巣明細胞腺がんと他の組織型の卵巣がんにおけるゲノムコピー数の違いを比較することに加え、全エクソンシークエンス、RNAシークエンスにより、卵巣明細胞腺がんの分子生物学的特徴を明らかにする。さらに、高異型度卵巣漿液性がんにおいても同様の網羅的ゲノム解析を行い、相同組換修復欠損のバイオマーカー、サブタイプ、予後規定因子を同定し、PARP阻害薬の有用性についても検討する。さらに、全エクソンシークエンス解析結果をもとに相同組換え修復欠損 (HRD) の有無を判定し、HRD陽性症例に対するPARP阻害薬オラパリブの有効性・安全性を調べる医師主導治験を行う。 また、子宮体がんにおける免疫制御メカニズムを理解することは、免疫療法戦略の改善に重要である。そのため、腫瘍免疫微小環境とHLAクラスI発現の関係を解明することで、特にCD8+ T細胞浸潤パターンへの影響を明らかにする。異なる組織学的、分子生物学的サブタイプにおける免疫回避の分子基盤を解明することで、個別化免疫療法の開発に貢献することを目指す。

研究方法: がんゲノムコピー数解析 (ゲノムワイドSNPタイピングアレイを使用し約26万個のSNPプローブの蛍光強度を測定し、がんと正常を比較することでコピー数異常を検出する) 、Whole Exome sequencing、RNA-seq、メチル化アレイ、発現アレイ、Target bisulfite sequencing

対象: 卵巣がん57 (類内膜がん12) +111+31+189症例、子宮体がん86症例

データセット一覧

データセット ID
アクセス制限
データの種類
公開日
JGAD000022制限公開(Type I)がんゲノムコピー数解析2020-09-28
JGAD000682制限公開(Type I)NGS(Exome、RNA-seq)2024-05-13
JGAD000931制限公開(Type I)NGS(Exome)2025-07-09
JGAD001041制限公開(Type I)NGS(Target bisulfite-seq)2026-04-22

提供者情報

    研究代表者
    織田 克利
    所属機関名
    東京大学医学部 産科婦人科学教室

研究プロジェクト情報

研究プロジェクト名
URL
データなし

助成金情報

科研費・助成金名
タイトル
研究課題番号
科学研究費助成事業 基盤研究 (S)統合的ゲノム解析によるがん細胞集団進化の解明
  • 24221011
科学研究費助成事業 基盤研究 (C)子宮体癌・卵巣癌においてアポトーシスを誘導する新規分子標的治療法の探
  • 26462515
科学研究費助成事業 若手研究 (B)卵巣明細胞腺癌における遺伝子プロファイルに基づく新規分子標的治療法の探索
  • 25861473
次世代がん研究シーズ戦略的育成プログラム (P-DIRECT)「分子プロファイリングによる新規標的同定を通じた難治がん治療法開発」 (進行性卵巣がんの治療感受性を規定する遺伝子変異の同定)
  • 11114014
科学研究費助成事業 若手研究 (B)卵巣明細胞癌におけるSWI/SNFクロマチンリモデリング複合体の異常と発癌過程
  • 22K16873
科学研究費助成事業 基盤研究 (C)卵巣癌における相同組換修復欠損に着目した新規分子標的治療法の探索
  • 18K09249
科学研究費助成事業 基盤研究 (B)卵巣癌におけるゲノム解析とオルガノイドによる薬剤感受性試験の臨床的有用性の検証
  • 21H03074
科学研究費助成事業 基盤研究 (B)卵巣癌/子宮体癌における薬剤感受性メチル化診断キットの開発とLiquid Biopsyへの応用
  • 24K02584

関連論文

タイトル
DOI
利用データID
Integrated Copy Number and Expression Analysis Identifies Profiles of Whole-Arm Chromosomal Alterations and Subgroups with Favorable Outcome in Ovarian Clear Cell Carcinomashttps://doi.org/10.1371/journal.pone.0128066
The frequency of neoantigens per somatic mutation rather than overall mutational load or number of predicted neoantigens per se is a prognostic factor in ovarian clear cell carcinomahttps://doi.org/10.1080/2162402x.2017.1338996
Neoantigen load and HLA-class I expression identify a subgroup of tumors with a T-cell-inflamed phenotype and favorable prognosis in homologous recombination-proficient high-grade serous ovarian carcinomahttps://doi.org/10.1136/jitc-2019-000375
Integrated genomic/epigenomic analysis stratifies subtypes of clear cell ovarian carcinoma, highlighting their cellular originhttps://doi.org/10.1038/s41598-024-69796-4
HLA class I dysregulation and immune microenvironment across endometrial cancer molecular subtypes

制限公開データの利用者一覧

研究代表者
所属機関
国・州名
研究題目
データ利用期間
利用データID
小西郁生Kyoto UniversityJapan多様な臨床情報を考慮した婦人科悪性腫瘍患者のオミックス解析(全ゲノム・全トランスクリプトーム・プロテオーム・メタボローム解析)による個別化治療の探索2015-07-032017-09-04
万代昌紀Kyoto University Faculty of MediceneJapan多様な臨床情報を考慮した婦人科悪性腫瘍患者のオミックス解析(全ゲノム・全トランスクリプトーム・プロテオーム・メタボローム解析)による個別化治療の探索2018-10-042025-04-14
松村謙臣Kindai UniversityJapanJGOG3017-TR1:エクソームシークエンスデータを有する卵巣明細胞癌のRNAseq解析2024-10-152027-12-31
村上隆介Kyoto UniversityJapanJGOG3017-TR1:エクソームシークエンスデータを有する卵巣明細胞癌のRNAseq解析2024-10-222027-12-31
山口建Kyoto UniversityJapanJGOG3017-TR1:エクソームシークエンスデータを有する卵巣明細胞癌のRNAseq解析2024-10-222027-12-31