データセット ID
JGAD000022
- データの種類
- がんゲノムコピー数解析
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 18.8 GB
- ファイル形式
- CEL
- 研究
- hum0030
- 公開日
- 2020-09-28
- 更新日
- 2020-09-28
- DDBJ Search
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- JGA Study
- JGAS000022 (新しいタブで開きます)
解析手法
Genotyping by array (CNV)
- 材料と対象者
- 卵巣がん：57症例
（卵巣明細胞腺がん：31症例、漿液性腺がん：14症例、類内膜腺がん：12症例） - 健康状態罹患
- 対象者数57 (人数)
- 試料説明
- 卵巣がん切片から腫瘍組織および非腫瘍組織を取り分け、それぞれDNAを抽出
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- Genotyping by array
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- GeneChip Human Mapping 250K Nsp Array
- プラットフォーム
- Affymetrix GeneChip Human Mapping 250K Nsp Array
- QC・フィルタリング
- N/A
- 解析方法
- genome imbalance map（GIM）algorithm（doi:10.1016/j.bbrc.2005.06.040）
- バリアント数
- 262,264 CNVs
- 表現型データの有無
- あり