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NBDC ヒトデータベース
JGAD000022
公開日
2020-09-28

更新日
2025-07-01

研究
hum0030

データの種類
がんゲノムコピー数解析

アクセス制限
制限公開(Type I)

JGA Study
JGAS000022

解析手法

Genotyping by array (CNV)

材料と対象者

卵巣がん: 57症例 (卵巣明細胞腺がん: 31症例、漿液性腺がん: 14症例、類内膜腺がん: 12症例)

実験方法

genome wide CNVs

プラットフォーム

Affymetrix [GeneChip Human Mapping 250K Nsp Array]

試料説明

卵巣がん切片から腫瘍組織および非腫瘍組織を取り分け、それぞれDNAを抽出

試薬

GeneChip Human Mapping 250K Nsp Array

解析方法

genome imbalance map(GIM)algorithm(doi: 10.1016/j.bbrc.2005.06.040)

CNV数

262,264 CNVs

JGAデータセットAccession
総データ量

17.5 GB

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