研究題目
ヒト初期発生にかかわる細胞のDNAメチル化解析基盤研究
研究概要
目的: ヒト初期発生過程におけるDNAメチル化ダイナミクスの解明
研究方法: post-bisulfite adaptor tagging (PBAT) 法によりライブラリー調製をし、Illimina社 HiSeq 2000もしくは2500を使用したメチル化解析
対象: 日本人正常卵子、精子、受精卵 (着床前胚) 、臍帯血から抽出したゲノムDNA
2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所（NIG）バイオデータ研究拠点（BSI）ライフサイエンス統合データベース部門（DBCLS）」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします
現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです
NBDC Research ID:hum0009-v3
リリース情報 データセット一覧
データセット ID | アクセス制限 | データの種類 | 公開日 | |
|---|---|---|---|---|
| DRA003802 | 非制限公開 | NGS(PBAT-seq) | 2015-07-31 | |
| JGAD000006 | 制限公開（Type I） | NGS(PBAT-seq) | 2020-09-28 | |
提供者情報
- 研究代表者
- 有馬 隆博
- 所属機関名
- 東北大学大学院 医学系研究科 環境遺伝医学総合研究センター 情報遺伝学分野
研究プロジェクト情報
研究プロジェクト名 | URL |
|---|---|
| データなし | |
助成金情報
科研費・助成金名 | タイトル | 研究課題番号 |
|---|---|---|
| 日本医療研究開発機構 革新的先端研究開発支援事業 (AMED-CREST) | 生殖発生にかかわる細胞のエピゲノム解析基盤研究 |
|
| 科学研究費助成事業 新学術領域研究 | ヒト生殖細胞のエピゲノムダイナミクスとその制御機構 |
|
関連論文
タイトル | DOI | 利用データID |
|---|---|---|
| Genome-Wide Analysis of DNA Methylation Dynamics during Early Human Development | https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1004868 | |
制限公開データの利用者一覧
研究代表者 | 所属機関 | 国・州名 | 研究題目 | データ利用期間 | 利用データID |
|---|---|---|---|---|---|
| Skaar David | North Carolina State University | USA | Epigenetics and Genetics Throughout the Lifespan | 2019-04-15—2021-02-02 | |
| Monk David | Bellvitge Institute for Biomedical Research (IDIBELL) | Spain | 胎盤におけるメチル化領域の生殖系由来を追跡すること。ヒト単為生殖幹細胞の発生期に異常に消失した卵母細胞由来のメチル化を特定すること。 | 2015-04-07—2015-08-04 | |
| 藤英博 | Medical Institute of Bioregulation Kyushu University | Japan | 生殖発生にかかわる細胞のエピゲノム解析基盤研究 | 2015-04-01—2015-08-04 | |