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NBDC ヒトデータベース

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2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所(NIG)バイオデータ研究拠点(BSI)ライフサイエンス統合データベース部門(DBCLS)」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします

データセット ID

DRA003802

データの種類
NGS(PBAT-seq)
アクセス制限
非制限公開
総データ量
275 GB
ファイル形式
  • FASTQ
研究
hum0009
公開日
2015-07-31
更新日
2015-07-27

解析手法

PBAT-seq

材料と対象者
11検体
正常卵子、精子、受精卵(着床前胚)、臍帯血
(卵子、着床前胚についてはプールしたDNAを使用)
  • 健康状態
    健常
  • 対象者数
    11 (検体数)
  • 性別
    混在
試料説明
それぞれの組織から抽出したDNAを使用
卵子(増幅有)※1:79検体をプール
卵子(増幅無)※1:123検体をプール
精子:3検体
受精卵(着床前胚):80検体をプール
臍帯血:5検体
  • 組織
    臍帯血、Embryo、Oocyte、Sperm
  • 腫瘍 / 非腫瘍
    非腫瘍
試料の入手元
N/A
実験方法
PBAT-seq
測定対象
N/A
試薬キット
Post-Bisulfite Adaptor-Tagging (PBAT)
断片化
バイサルファイト処理
プラットフォーム
Illumina HiSeq 2000
Illumina HiSeq 2500
リードタイプ
シングルエンド
リード長
100 bp