データセット ID
NHA000153
- データの種類
- 小児ネフローゼ症候群987症例および対照3,206名のGWAS
- アクセス制限
- 非制限公開
- 総データ量
- 125 MB
- ファイル形式
- XLSX
- ZIP
- 研究
- hum0126
- 公開日
- 2020-09-01
- 更新日
- 2020-09-01
- Secondary ID
- hum0126.v2.imp-gwas.v1
このデータセットに紐づく非制限公開ファイル
| ファイル名 | ラベル | サイズ | URL のコピー |
|---|---|---|---|
| hum0126.v2.imp-gwas.v1.zip | 125 MB | ||
| hum0126_ | Dictionary file | 11.8 KB |
解析手法
Genotyping by array
- 材料と対象者
- 小児ネフローゼ症候群（ICD10：N049）：987症例
対照健常者：3,206名 - 健康状態混在
- 対象者数4193 (人数)
- 年齢層小児
- 疾患
- 小児ネフローゼ症候群 (N049)
- 試料説明
- 末梢血から抽出したDNA
- 組織末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- Genotyping by array
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- Axiom 2.0 Reagent Kit
- プラットフォーム
- Affymetrix Japonica Array
- 参照ゲノム
- GRCh37
- QC・フィルタリング
- Sample Call rate < 0.97, SNP call rate < 0.97, HWE P < 0.0001, MAF < 0.05
Imputation quality (Rsq) < 0.5 - 解析方法
- Axiom Analysis suite 1.0.0.3
- バリアント数
- 6,834,340 SNPs