データセット ID
NHA000050
- データの種類
- PBC 487症例および健常対照者476名のGWAS
- アクセス制限
- 非制限公開
- 総データ量
- 58.0 MB
- ファイル形式
- CSV
- XLSX
- 研究
- hum0076
- 公開日
- 2016-10-05
- 更新日
- 2016-10-05
- Secondary ID
- hum0076.v1.gwas.v1
このデータセットに紐づく非制限公開ファイル
| ファイル名 | ラベル | サイズ | URL のコピー |
|---|---|---|---|
| hum0076_ | 58.0 MB | ||
| hum0076_ | Dictionary file | 11.0 KB |
解析手法
Genotyping by array
- 材料と対象者
- PBC：487症例
健常対照者：476名 - 健康状態混在
- 対象者数963 (人数)
- 試料説明
- 末梢血から抽出したgDNA
- 組織末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- Genotyping by array
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- Axiom 2.0 Reagent Kit
- プラットフォーム
- Affymetrix Axiom Genome-Wide ASI 1 Array
- 参照ゲノム
- GRCh37
- QC・フィルタリング
- Sample Call rate < 0.97, SNP call rate < 0.95, HWE P < 0.001, MAF < 0.05
- 解析方法
- GenCall software（Genotyping Console ver. 4.2.0.26）
- バリアント数
- 425,736 SNPs
- 加工データの種類
- 変異コール