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NBDC ヒトデータベース

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システムメンテナンスに伴い、以下の日程で、NBDCヒトデータベース申請システムならびにヒトデータ審査委員会による審査が停止いたします。
停止期間：2026年10月5日(月) 9:00 ～ 10月7日(水) 15:00
ご迷惑をおかけしますが、どうぞ宜しくお願いいたします。

現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです

2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所（NIG）バイオデータ研究拠点（BSI）ライフサイエンス統合データベース部門（DBCLS）」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします

データセット ID

NHA000003

データの種類
SNP-Chipを用いて決定した遺伝子型2994名分の頻度情報
アクセス制限
非制限公開
総データ量
70.6 MB
ファイル形式
  • XLSX
  • PNG
  • ZIP
研究
hum0013
公開日
2014-10-16
更新日
2014-10-16
Secondary ID
hum0013.v1.freq.v1

このデータセットに紐づく非制限公開ファイル

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Count.png19.1 KB
SNPs_eachChr.png35.6 KB
SampleNo_eachArea.png29.8 KB
hum0013.v1.freq.v1.zip70.5 MB
hum0013_header_definition.xlsxDictionary file10.0 KB

解析手法

Genotyping by array

材料と対象者
日本人健常人 2994名
  • 健康状態
    健常
  • 対象者数
    2994 (人数)
  • 対象集団
    日本人
試料説明
末梢血から抽出したgDNA
  • 組織
    末梢血
  • 腫瘍 / 非腫瘍
    非腫瘍
試料の入手元
N/A
実験方法
Genotyping by array
測定対象
N/A
試薬キット
HumanOmni2.5 BeadChip Kit
プラットフォーム
Illumina HumanOmni2.5
QC・フィルタリング
Call Rate ≧ 0.95 かつ HWE ≧ 0.001
解析方法
GenomeStudio
バリアント数
2,343,307 SNVs (/files/hum0013/SNPs_eachChr.png)
利用ポリシー
NBDC データ共有ポリシー (JGAP000001)