データセット ID
NHA000002
- データの種類
- 全染色体領域を対象としたNGSにて1070名の塩基配列を決定し、検出されたバリアントから常染色体上の既知のSNVの内頻度が5％を超えるものについての頻度情報
- アクセス制限
- 非制限公開
- 総データ量
- 74.5 MB
- ファイル形式
- ZIP
- 研究
- hum0015
- 公開日
- 2014-10-14
- 更新日
- 2014-10-14
- Secondary ID
- hum0015.v1.freq.v1
このデータセットに紐づく非制限公開ファイル
| ファイル名 | ラベル | サイズ | URL のコピー |
|---|---|---|---|
| hum0015.v1.freq.v1.zip | 74.5 MB |
解析手法
WGS
- 材料と対象者
- 日本人成人健常人：1070名
- 健康状態健常
- 対象者数1070 (人数)
- 対象集団日本人
- 年齢層成人
- 試料説明
- 末梢血から抽出したgDNA
- 組織末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- WGS
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- TruSeq DNA PCR-Free Library Prep Kit
- 断片化
- 超音波断片化（Covaris LE220）
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2500
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- N/A
- 参照ゲノム
- GRCh37
- マッピング
- N/A
- マッピング品質
- N/A
- QC・フィルタリング
- N/A
- 解析方法
- N/A
- カバレッジ (深度)
- 32.4x
- バリアント数
- 4,301,546 SNPs