データセット ID
JGAD001125
- データの種類
- Xenium In Situ Gene Expression、NGS（RNA-seq）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 315 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- PARQUET
- HDF5
- TIFF
- 研究
- hum0030
- 公開日
- 2026-10-23
- 更新日
- 2026-10-23
- DDBJ Search
- JGAD001125 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000964 (新しいタブで開きます)
解析手法
Xenium In Situ Gene Expression
- 試料 / 対象者
- 子宮がん肉腫（UCS）：8症例
腫瘍組織（FFPE）：8検体 - 健康状態罹患
- 対象者数8 (人数)
- 対象集団日本人
- 性別女性
- 疾患
- 子宮がん肉腫
- 試料説明
- 腫瘍組織（FFPE）
- 組織子宮
- 腫瘍 / 非腫瘍腫瘍
- 購入試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- Spatial transcriptomics
- 対象領域
- 330遺伝子カスタムパネル（Xenium Human Breast Gene Expression Panel 280遺伝子＋子宮がん肉腫関連50遺伝子）
- 試薬キット
- Xenium Cell Segmentation Add-on kit
Xenium Decoding Consumables
Xenium Decoding Reagents
Xenium Slides & Sample Prep Reagents - プラットフォーム
- 10x Genomics Xenium Analyzer
- 解析方法
- xenium-3.0.0.15、xenium-3.2.0.7
RNA-seq
- 試料 / 対象者
- 子宮がん肉腫（UCS）：8症例
腫瘍組織（FFPE）：60検体 - 健康状態罹患
- 対象者数8 (人数)
- 対象集団日本人
- 性別女性
- 疾患
- 子宮がん肉腫
- 試料説明
- 微小組織切片から抽出したRNA
- 組織子宮
- 腫瘍 / 非腫瘍腫瘍
- 購入試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- RNA-seq
- 対象領域
- N/A
- 試薬キット
- Smart-seq2
- 断片化
- Tn5 transposaseによるタグメンテーション
- プラットフォーム
- Illumina MiSeq
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 75 bp