データセット ID
JGAD001102
- データの種類
- NGS(RNA-seq)
- アクセス制限
- 制限公開(Type I)
- 研究
- hum0606
- DDBJ Search
- JGAD001102 (新しいタブで開きます)
解析手法
RNA-seq
- 材料と対象者
- 子宮体がん:1症例
腫瘍組織(新鮮凍結:1検体、細胞診:1検体)
乳がん細胞株由来xenograft:1モデル
腫瘍組織(新鮮凍結:1検体、細胞診:1検体) - 健康状態罹患
- 対象者数4 (検体数)
- 性別女性
- 疾患
- 子宮体がん
- 乳がん
- 試料説明
- 腫瘍組織から抽出したRNA
- 組織子宮
- 腫瘍 / 非腫瘍腫瘍
- 試料の入手元
- 乳がん細胞株:BT-474(ATCC ID: HTB-20)
- 実験方法
- RNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- Illumina Stranded Total RNA Prep, Ligation with Ribo-Zero Plus
- 断片化
- 専用試薬存在下での加熱によるRNA断片化
- プラットフォーム
- Illumina NovaSeq 6000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 100 bp