データセット ID
JGAD001062
- データの種類
- Xenium In Situ Gene Expression
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 27.9 GB
- ファイル形式
- PARQUET
- HDF5
- TIFF
- 研究
- hum0358
- 公開日
- 2026-08-21
- 更新日
- 2026-08-21
- DDBJ Search
- JGAD001062 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000918 (新しいタブで開きます)
このデータセットに紐づく非制限公開ファイル
| ファイル名 | ラベル | サイズ | URL のコピー |
|---|---|---|---|
| gene_ | 330遺伝子 | 15.1 KB |
解析手法
Spatial transcriptomics
- 材料と対象者
- 子宮頸部小細胞神経内分泌がん（SCNEC）と腺がんとの混合組織型を呈するHPV18陽性子宮頸がん（ICD10：C539）：1症例
腫瘍組織（FFPE）：1検体 - 健康状態罹患
- 対象者数1 (人数)
- 性別女性
- 疾患
- 子宮頸部小細胞神経内分泌がん（SCNEC）と腺がんとの混合組織型を呈するHPV18陽性子宮頸がん
- 試料説明
- 腫瘍組織（FFPE）
- 腫瘍 / 非腫瘍腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- Spatial transcriptomics
- 測定対象
- 330遺伝子（Xenium Human Breast Gene Expression Panel：280遺伝子、Xenium Add-on Custom 1 to 50 Gene Panel：子宮頸がん特異的50遺伝子）
- 試薬キット
- Xenium Cell Segmentation Add-on kit
Xenium Decoding Consumables
Xenium Decoding Reagents
Xenium Slides & Sample Prep Reagents - プラットフォーム
- 10x Genomics Xenium Analyzer
- 解析方法
- R（version 4.4.2）、Seurat（version 5.3）、Monocle3（version 1.3.7）、Slingshot、tradeSeq、DESeq2（version 1.48.1）