データセット ID
JGAD000989
- データの種類
- NGS
（RNA-seq、ChIP-seq） - アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 93.8 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- GZIP
- 研究
- hum0231
- 公開日
- 2026-11-06
- 更新日
- 2026-11-06
- DDBJ Search
- JGAD000989 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000847 (新しいタブで開きます)
解析手法
RNA-seq
- 試料 / 対象者
- COVID19重症化関連多型を有しない健常人ドナー2名由来のiPS細胞（ゲノム編集株を含む）から分化させた単球およびマクロファージ
- 39検体 - 健康状態健常
- 対象者数2 (人数)
- 対象集団日本人
- 試料説明
- 健常人ドナー由来のiPS細胞（ゲノム編集株を含む）から分化させた単球およびマクロファージから抽出したRNA
- 組織マクロファージ、単球
- 購入試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- RNA-seq
- 対象領域
- N/A
- 試薬キット
- ThruPLEX DNA-Seq Kit
- 断片化
- 超音波断片化（Covaris M220）
- プラットフォーム
- Illumina NextSeq 500
- リードタイプ
- シングルエンド
- リード長
- 75 bp
ChIP-seq
- 試料 / 対象者
- COVID19重症化関連多型を有しない健常人ドナー2名由来のiPS細胞（ゲノム編集株を含む）から分化させたマクロファージ
- 37検体 - 健康状態健常
- 対象者数2 (人数)
- 対象集団日本人
- 試料説明
- マクロファージから抽出したDNAに対し、抗H3K27ac抗体、抗H3K4me1抗体、抗CTCF抗体、抗SMC1A抗体、抗IRF8抗体、抗PU1抗体、抗MAFB抗体、もしくは抗BCL6抗体を用いて免疫沈降
- 組織マクロファージ
- 購入試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- ChIP-seq
- 対象領域
- N/A
- 試薬キット
- ThruPLEX DNA-Seq Kit
- 断片化
- 超音波断片化
- プラットフォーム
- Illumina NextSeq 500
- リードタイプ
- シングルエンド
- リード長
- 75 bp