データセット ID
JGAD000988
- データの種類
- NGS（scRNA-seq）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 62.9 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- HDF5
- 研究
- hum0406
- 公開日
- 2026-03-31
- 更新日
- 2026-04-03
- DDBJ Search
- JGAD000988 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000846 (新しいタブで開きます)
解析手法
scRNA-seq
- 材料と対象者
- CCNOバリアントを持つ原発性線毛機能不全症（ICD10：Q348）：1症例
1: 患者末梢血から樹立したiPS細胞由来気道上皮細胞シート ：1検体
2: 患者末梢血から樹立した修復iPS細胞由来気道上皮細胞シート ：1検体 - 健康状態罹患
- 対象者数1 (人数)
- 疾患
- CCNOバリアントを持つ原発性線毛機能不全症
- 試料説明
- ヒトiPS細胞由来の気道上皮細胞に対し、気液界面培養を用いて分化誘導後、単離した細胞より抽出したRNA
- 組織Airway epithelial cell
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 細胞株
- Gene-corrected iPSC-derived airway epithelial cell sheet
iPSC-derived airway epithelial cell sheet - 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- scRNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- Chromium GEM-X Single Cell 3' v4
- 断片化
- 上記キットに準拠（酵素反応）
- プラットフォーム
- Illumina NovaSeq 6000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- Read 1: 28 bp
Read 2: 90 bp - 参照ゲノム
- GRCh38
- マッピング
- Cell Ranger（v8.0.1）
- QC・フィルタリング
- Cell Ranger（v8.0.1）
- 解析方法
- Cell Ranger（v8.0.1）
- 遺伝子数
- 38,606