本文へ
NBDC ヒトデータベース

カートに入れたデータセットはありません。

現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです

2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所(NIG)バイオデータ研究拠点(BSI)ライフサイエンス統合データベース部門(DBCLS)」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします

データセット ID

JGAD000978

データの種類
NGS(Amplicon-seq)
アクセス制限
制限公開(Type I)
総データ量
7.2 GB
ファイル形式
  • FASTQ
研究
hum0531
公開日
2025-11-12
更新日
2025-11-12

解析手法

RNA Amplicon-seq

材料と対象者
進行性尿路上皮がん(ICD10:C67、C65、C66):15症例
腫瘍組織(FFPE)15検体
cfDNA(血漿)50検体
  • 健康状態
    罹患
  • 対象者数
    15 (人数)
疾患
  • 進行性尿路上皮がん
試料説明
腫瘍組織から抽出したDNAおよびcfDNA
  • 組織
    血漿
  • 腫瘍 / 非腫瘍
    混在
試料の入手元
N/A
実験方法
Amplicon-seq
測定対象
TP53、FGFR3、TERT、KRAS/HRAS
断片化
FFPE:超音波断片化(Covaris)
血漿cfDNA:-
プラットフォーム
Thermo Fisher Scientific Ion PGM
Thermo Fisher Scientific Ion S5
リードタイプ
ペアエンド
リード長
150 bp