データセット ID
JGAD000978
- データの種類
- NGS(Amplicon-seq)
- アクセス制限
- 制限公開(Type I)
- 総データ量
- 7.2 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0531
- 公開日
- 2025-11-12
- 更新日
- 2025-11-12
- DDBJ Search
- JGAD000978 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000836 (新しいタブで開きます)
解析手法
RNA Amplicon-seq
- 材料と対象者
- 進行性尿路上皮がん(ICD10:C67、C65、C66):15症例
腫瘍組織(FFPE)15検体
cfDNA(血漿)50検体 - 健康状態罹患
- 対象者数15 (人数)
- 疾患
- 進行性尿路上皮がん
- 試料説明
- 腫瘍組織から抽出したDNAおよびcfDNA
- 組織血漿
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- Amplicon-seq
- 測定対象
- TP53、FGFR3、TERT、KRAS/HRAS
- 断片化
- FFPE:超音波断片化(Covaris)
血漿cfDNA:- - プラットフォーム
- Thermo Fisher Scientific Ion PGM
Thermo Fisher Scientific Ion S5 - リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 150 bp