2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所（NIG）バイオデータ研究拠点（BSI）ライフサイエンス統合データベース部門（DBCLS）」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします
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目的: 泌尿器腫瘍 (前立腺がん・腎がん・膀胱がんなど) は増加傾向にあり、後天的ゲノム異常が発症に関与している。従来の遺伝子異常のみでは発がん過程を十分に説明できず、構造異常や微小環境の影響も注目されている。近年の次世代シークエンサーの進展により、全ゲノム・エクソーム・RNA・シングルセル解析が可能となり、腫瘍特異的な変化の網羅的同定が可能となった。本研究では、泌尿器腫瘍における体細胞変異の解明を目的に、正常細胞との比較を含めた網羅的ゲノム解析を行い、新たな原因分子や治療標的の探索を目指す。
研究方法: NOIR-SS法を用いたターゲットパネル解析を実施。腫瘍組織ではTP53、FGFR3、TERT、KRAS/HRASのホットスポット変異を同定し、血漿cfDNAでは同一変異を対象としたtumor-informed型解析を行った。
対象: 進行性尿路上皮がん15症例 腫瘍組織 (FFPE、15検体) 、血漿cfDNA (50検体)
データセット ID | アクセス制限 | データの種類 | 公開日 | |
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| JGAD000978 | 制限公開（Type I） | NGS(Amplicon-seq) | 2025-11-12 | |
研究プロジェクト名 | URL |
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| データなし | |
科研費・助成金名 | タイトル | 研究課題番号 |
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| 科学研究費助成事業 基盤研究 (C) | NOIR-SSを用いた淡明細胞型腎癌におけるctDNAの定量と背景因子の解明 |
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タイトル | DOI | 利用データID |
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| High Sensitivity ctDNA Analysis Using a Novel Panel and NOIR-SS Technology for Monitoring Advanced Urothelial Carcinoma | ||
研究代表者 | 所属機関 | 国・州名 | 研究題目 | データ利用期間 | 利用データID |
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| データなし | |||||