2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所（NIG）バイオデータ研究拠点（BSI）ライフサイエンス統合データベース部門（DBCLS）」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします
現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです
NBDC ヒトデータベース申請業務ならびにJGA関係の業務につきまして、以下の期間休業いたします：2026年8月12日(水) 〜 2026年8月17日(月) 休業期間中にいただいた申請やお問い合わせ等は、休業明けの 8月18日(火) より順次対応させていただきます。 上記休業期間の前後は通常より対応が遅れることがあります。予めご了承ください。 ご迷惑をおかけいたしますが、ご理解とご協力をお願いいたします。
- 公開日
- 2026-07-30
- 更新日
- 2026-07-30
- 研究
- hum0511
- データの種類
- NGS(scRNA-seq, scTCR-seq, scCITE-seq)
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- JGA Study
- JGAS000815
解析手法
scRNA-seq
- 材料と対象者
データセット1: 健常者28名
70～90歳代: 8名
100歳代: 10名
110歳代: 10名
データセット2: データセット1に含まれる健常者6名
70～90歳代: 2名
100歳代: 2名
110歳代: 2名- 実験方法
scRNA-seq
- プラットフォーム
MGI Tech [MGISEQ-2000RS]
- 試料説明
データセット1: 末梢血T細胞から抽出したRNA
データセット2: PMAとイオノマイシンで6時間刺激した末梢血T細胞から抽出したRNA- ライブラリ構築
Chromium Next GEM Single Cell 5' v2
- 断片化
酵素反応
- リードタイプ
Paired-end
- リード長
Read1 72bp、Read2 91bp
- 解析方法
Cell Ranger 6.1.2
- フィルタリング
Cell Ranger 6.1.2
- マッピング
Cell Ranger 6.1.2
- リファレンス配列
refdata-gex-GRCh38-2020-A
- JGAデータセットAccession
- 総データ量
1.1 TB (fastq)
- 利用ポリシー
NBDC policy および hum0511 policy 誓約書をご確認ください。
scTCR-seq
- 材料と対象者
データセット1: 健常者28名
70～90歳代: 8名
100歳代: 10名
110歳代: 10名
データセット2: データセット1に含まれる健常者6名
70～90歳代: 2名
100歳代: 2名
110歳代: 2名- 実験方法
scTCR-seq
- プラットフォーム
MGI Tech [MGISEQ-2000RS]
- 試料説明
データセット1: 末梢血T細胞から抽出したRNA
データセット2: PMAとイオノマイシンで6時間刺激した末梢血T細胞から抽出したRNA- ライブラリ構築
Chromium Single Cell V (D) J Enrichment Kit, Human T Cell
- 断片化
酵素反応
- リードタイプ
Paired-end
- リード長
Read1 72bp, Read2 91bp
- 解析方法
Cell Ranger 6.1.2
- フィルタリング
Cell Ranger 6.1.2
- マッピング
Cell Ranger 6.1.2
- リファレンス配列
refdata-cellranger-vdj-GRCh38-alts-ensembl-5.0.0
- JGAデータセットAccession
- 総データ量
1.1 TB (fastq)
- 利用ポリシー
NBDC policy および hum0511 policy 誓約書をご確認ください。
scCITE-seq
- 材料と対象者
データセット1: 健常者28名
70～90歳代: 8名
100歳代: 10名
110歳代: 10名
データセット2: データセット1に含まれる健常者6名
70～90歳代: 2名
100歳代: 2名
110歳代: 2名- 実験方法
scCITE-seq
- ターゲット
CD3、CD4、CD8、CD25、CD27、CD28、CD45RA、CD45RO、CD95、TCRD、CCR7、IL7RA、PD-1、CD161、KLRG1、CD56
- プラットフォーム
MGI Tech [MGISEQ-2000RS]
- 試料説明
データセット1: 末梢血T細胞から抽出したRNA
データセット2: PMAとイオノマイシンで6時間刺激した末梢血T細胞から抽出したRNA- ライブラリ構築
Chromium Single Cell 5′ Feature Barcode Library Kit
- 断片化
酵素反応
- リードタイプ
Paired-end
- リード長
Read1 0bp, Read2 15bp
- 解析方法
Cell Ranger 6.1.2
- フィルタリング
Cell Ranger 6.1.2
- マッピング
Cell Ranger 6.1.2
- JGAデータセットAccession
- 総データ量
1.1 TB (fastq)
- 利用ポリシー
NBDC policy および hum0511 policy 誓約書をご確認ください。