データセット ID
JGAD000911
- データの種類
- NGS(scRNA-seq)
- アクセス制限
- 制限公開(Type I)
- 総データ量
- 126 GB
- ファイル形式
- BAM
- 研究
- hum0490
- 公開日
- 2024-12-20
- 更新日
- 2025-12-11
- DDBJ Search
- JGAD000911 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000770 (新しいタブで開きます)
解析手法
scRNA-seq
- 材料と対象者
- 正常卵巣機能を有する不妊症(ICD10:N97):16症例
排卵誘発法(GnRH-ant)実施群: 8症例
PPOS実施群:8症例 - 健康状態罹患
- 対象者数16 (人数)
- 疾患
- 正常卵巣機能を有する不妊症 (N97)
- 試料説明
- 各症例から同じ数のmGC細胞を混合した検体から抽出したRNA
- 組織Granulosa cell
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- scRNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- Chromium Single Cell V(D)J
- 断片化
- 酵素反応(10x Genomicsキット)
- プラットフォーム
- MGI DNBSEQ-G400
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 72 bp (R1)
91 bp (R2) - 参照ゲノム
- GRCh38
- マッピング
- 10x Genomics Cell Ranger Count
- マッピング品質
- Reads Mapped to Genome 98.9% (TFHS000278), 98.6% (TFHS000279)