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NBDC ヒトデータベース

カートに入れたデータセットはありません。

システムメンテナンスに伴い、以下の日程で、NBDCヒトデータベース申請システムならびにヒトデータ審査委員会による審査が停止いたします。
停止期間:2026年10月5日(月) 9:00 ~ 10月7日(水) 15:00
ご迷惑をおかけしますが、どうぞ宜しくお願いいたします。

現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです

2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所(NIG)バイオデータ研究拠点(BSI)ライフサイエンス統合データベース部門(DBCLS)」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします

データセット ID

JGAD000911

データの種類
NGS(scRNA-seq)
アクセス制限
制限公開(Type I)
総データ量
126 GB
ファイル形式
  • BAM
研究
hum0490
公開日
2024-12-20
更新日
2025-12-11

解析手法

scRNA-seq

材料と対象者
正常卵巣機能を有する不妊症(ICD10:N97):16症例
排卵誘発法(GnRH-ant)実施群: 8症例
PPOS実施群:8症例
  • 健康状態
    罹患
  • 対象者数
    16 (人数)
疾患
正常卵巣機能を有する不妊症 (N97)
試料説明
各症例から同じ数のmGC細胞を混合した検体から抽出したRNA
  • 組織
    Granulosa cell
  • 腫瘍 / 非腫瘍
    非腫瘍
試料の入手元
N/A
実験方法
scRNA-seq
測定対象
N/A
試薬キット
Chromium Single Cell V(D)J
断片化
酵素反応(10x Genomicsキット)
プラットフォーム
MGI DNBSEQ-G400
リードタイプ
ペアエンド
リード長
72 bp (R1)
91 bp (R2)
参照ゲノム
GRCh38
マッピング
10x Genomics Cell Ranger Count
マッピング品質
Reads Mapped to Genome 98.9% (TFHS000278), 98.6% (TFHS000279)