データセット ID
JGAD000906
- データの種類
- NGS（WGS）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 314 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- CSV
- 研究
- hum0486
- 公開日
- 2024-12-02
- 更新日
- 2025-10-24
- DDBJ Search
- JGAD000906 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000765 (新しいタブで開きます)
解析手法
WGS
- 材料と対象者
- 胆道閉鎖症（I cyst型）（ICD10：Q44.2）：5 症例
末梢血から作製されたiPS細胞：5検体 - 健康状態罹患
- 対象者数5 (人数)
- 疾患
- 胆道閉鎖症（I cyst型） (Q442)
- 試料説明
- iPS細胞から抽出したDNA
- 組織iPS 細胞、末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 細胞株
- iPSC
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- WGS
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- Illumina DNA PCR-Free Prep
- 断片化
- 超音波断片化
- プラットフォーム
- Illumina NovaSeq X Plus
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 150 bp
- 参照ゲノム
- GRCh37
- マッピング
- CLC Genomics Workbench version 20
- マッピング品質
- Q30 > 80%
- カバレッジ (深度)
- 30x (超)