データセット ID
JGAD000857
- データの種類
- NGS(RNA-seq)
- アクセス制限
- 制限公開(Type I)
- 総データ量
- 244 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0473
- 公開日
- 2025-06-30
- 更新日
- 2025-06-30
- DDBJ Search
- JGAD000857 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000724 (新しいタブで開きます)
解析手法
RNA-seq
- 材料と対象者
- MDS(ICD10:D46):57症例
対照健常者:5名
骨髄単核球:合計62検体 - 健康状態混在
- 対象者数62 (人数)
- 疾患
- MDS (D46)
- 試料説明
- 骨髄単核球から分取したCD34陽性細胞より抽出したRNA
- 組織骨髄、Bone marrow mononuclear cell
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- RNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- NEBNext Poly(A) mRNA Magnetic Isolation Module
NEBNext Ultra II Directional RNA Library Prep Kit for Illumina - 断片化
- NEBNext Magnesium RNA Fragmentation Module
- プラットフォーム
- Illumina NovaSeq 6000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 150 bp