データセット ID
JGAD000826
- データの種類
- NGS（RNA-seq）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 16.5 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- CSV
- 研究
- hum0393
- 公開日
- 2025-04-10
- 更新日
- 2025-04-10
- DDBJ Search
- JGAD000826 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000693 (新しいタブで開きます)
解析手法
RNA-seq
- 材料と対象者
- 未治療の関節リウマチ（ICD10：M069）：6症例（6検体）
健常者：6名（6検体） - 健康状態混在
- 対象者数22 (人数)
- 年齢層混在
- 疾患
- 未治療の関節リウマチ
- 試料説明
- 末梢血から分取したCD4+CD45RA-CD25hiCD127lo Treg細胞から抽出したRNA
- 組織CD19+ cell、末梢血単核球 (PBMC)、末梢血、Submandibular gland、T 細胞、Treg cell
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- RNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- NEBNext Ultra II DNA Library Prep Kit for Illumina
SMART-Seq - 断片化
- 上記キットに準拠
- プラットフォーム
- Illumina NextSeq 500
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 36 bp
- 参照ゲノム
- GRCh37
- マッピング
- CLC Genomics Workbench
- QC・フィルタリング
- N/A
- 解析方法
- CLC Genomics Workbench
- 遺伝子数
- 57,768
- 加工データの種類
- TPM