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NBDC ヒトデータベース
NBDC Research ID:hum0393-v2
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研究題目

膠原病類縁疾患患者検体を用いた新規バイオマーカーおよび治療標的分子探索に関する研究

研究概要

目的: 膠原病類縁疾患の新規バイオマーカーおよび治療標的分子の探索

研究方法: JGAS000693: Moflo XDPセルソーター (Beckman Coulter) によりCD4+CD45RA-CD25hiCD127lo Treg細胞を分取後、TRIZOL-LS (ThermoFisher/Invitrogen) にて抽出したRNAを用いたRNA-seq解析 JGAS000630: human CD19 MicroBeads (Miltenyi Biotec) およびhuman PanT Cell Isolation Kit (Miltenyi Biotec) を用いてCD19+細胞およびT細胞を回収し、TRIZOL-LS (ThermoFisher/Invitrogen) にて抽出したRNAを用いたRNA-seq解析

対象: JGAS000693: 未治療の関節リウマチ6症例、対照健常者6名 JGAS000630: 未治療のIgG4関連疾患4症例、アメリカリウマチ学会/ヨーロッパリウマチ学会の基準を満たす原発性シェーグレン症候群3症例および対照健常者3名

データセット一覧

データセット ID
アクセス制限
データの種類
公開日
JGAD000826制限公開（Type I）NGS(RNA-seq)2025-04-10
JGAD000760制限公開（Type I）NGS(RNA-seq)2025-10-29

提供者情報

    研究代表者
    坪井 洋人
    所属機関名
    筑波大学 医学医療系 膠原病リウマチアレルギー内科学

研究プロジェクト情報

研究プロジェクト名
URL
データなし

助成金情報

科研費・助成金名
タイトル
研究課題番号
科学研究費助成事業 基盤研究 (B)関節リウマチにおける濾胞性制御性T細胞の機能と疲弊の解明
  • 21H02959
JST科学技術イノベーション創出に向けた大学フェローシップ創設事業関節リウマチの加齢に伴う制御性T細胞の機能変化解析
  • JPMJFS2106
科学研究費助成事業 基盤研究 (C)IgG4関連疾患におけるRNA-Seqを用いた遺伝子発現解析と新規治療標的の開発
  • 21K08471

関連論文

タイトル
DOI
利用データID
Mechanisms of age-related Treg dysfunction in an arthritic environmenthttps://doi.org/10.1016/j.clim.2024.110337
Analysis of lymphocytes specific gene expression pattern by RNA-Seq in patients with IgG4-related disease: Comparison between submandibular glands and peripheral bloodhttps://doi.org/10.1093/mr/roaf059

制限公開データの利用者一覧

研究代表者
所属機関
国・州名
研究題目
データ利用期間
利用データID
浜田道昭Waseda UniversityJapanRNA標的創薬データベースの構築2023-01-05—2027-10-31
上原剛Shinshu universityJapanIgG4関連疾患および類似疾患における分子発現プロファイルの統合解析 ― 公開トランスクリプトームデータおよび自施設病理検体を用いた検討 ―2026-02-26—2031-01-31