データセット ID
JGAD000760
- データの種類
- NGS（RNA-seq）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 26.0 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- CSV
- 研究
- hum0393
- 公開日
- 2025-10-29
- 更新日
- 2025-10-29
- DDBJ Search
- JGAD000760 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000630 (新しいタブで開きます)
解析手法
RNA-seq
- 材料と対象者
- IgG4関連疾患（ICD10：M359）：4症例
顎下腺：3検体
末梢血単核球：4検体
原発性シェーグレン症候群（ICD10：M350）：3症例
末梢血単核球：3検体
健常者：3名
末梢血単核球：3検体
各検体からCD19+細胞およびT細胞を1検体ずつ取得：合計 26検体 - 健康状態混在
- 対象者数22 (人数)
- 疾患
- IgG4関連疾患
- 原発性シェーグレン症候群
- 試料説明
- CD19+細胞検体およびT細胞検体から抽出したRNA
- 組織末梢血、Submandibular gland
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- RNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- NEBNext Ultra II DNA Library Prep Kit for Illumina
SMART-Seq - 断片化
- 上記キットに準拠
- プラットフォーム
- Illumina NextSeq 500
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 36 bp
- 参照ゲノム
- GRCh37
- マッピング
- CLC Genomics Workbench
- QC・フィルタリング
- N/A
- 解析方法
- CLC Genomics Workbench
- 遺伝子数
- 57,768