データセット ID
JGAD000790
- データの種類
- NGS（RNA-seq）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 180 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0433
- 公開日
- 2024-09-26
- 更新日
- 2025-08-26
- DDBJ Search
- JGAD000790 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000660 (新しいタブで開きます)
解析手法
RNA-seq
- 材料と対象者
- 妊娠高血圧症候群（ICD10：O149）：10症例26検体（分娩後の胎盤と脱落膜組織から樹立したヒト胎盤幹細胞株）
3症例：各3検体（細胞性栄養膜細胞、絨毛外栄養膜細胞、合胞体栄養膜細胞）
7症例：各1検体（合胞体栄養膜細胞）
10症例：各1検体（低酸素曝露後のヒト胎盤幹細胞株）
正常妊娠：11名28検体（分娩後の胎盤と脱落膜組織から樹立したヒト胎盤幹細胞株）
3名：各3検体（細胞性栄養膜細胞、絨毛外栄養膜細胞、合胞体栄養膜細胞）
8名：各1検体（合胞体栄養膜細胞）
11症例：各1検体（低酸素曝露後のヒト胎盤幹細胞株） - 健康状態混在
- 対象者数21 (人数)
- 性別女性
- 疾患
- 妊娠高血圧症候群 (O149)
- 試料説明
- ヒト胎盤幹細胞株および栄養膜細胞より抽出したRNA
- 組織脱落膜、胎盤、栄養膜幹細胞
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 細胞株
- Extravillous trophoblast (EVT)
Syncytiotrophoblast (ST)
Trophoblast stem cell (TS) - 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- RNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- NEBNext Ultra II Directional RNA Library Prep Kit for Illumina
- 断片化
- 上記キットに準拠
- プラットフォーム
- Illumina NovaSeq 6000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 150 bp