データセット ID
JGAD000571
- データの種類
- NGS（bulk RNA-seq）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 7.6 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0147
- 公開日
- 2023-05-10
- 更新日
- 2023-05-10
- DDBJ Search
- JGAD000571 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000454 (新しいタブで開きます)
解析手法
bulk RNA-seq
- 材料と対象者
- 腎がん（ICD10：C64）：2症例
末梢血T細胞：各6分画（Fr1, Fr2, Fr3, Fr4, Fr5, Fr6）
腫瘍浸潤T細胞：各4分画（Fr2, Fr3, Fr4, Fr5）
肺がん（ICD10：C34）：3症例
腫瘍浸潤T細胞：各2分画 - 健康状態罹患
- 対象者数3 (人数)
- 疾患
- 腎がん (C64)
肺がん (C34) - 試料説明
- 末梢血T細胞分画および腫瘍浸潤T細胞分画から抽出したRNA
- 組織末梢血単核球 (PBMC)、末梢血、TIL
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- RNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- KAPA Hyper Prep Kit
- 断片化
- KAPA Frag
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2500
Illumina HiSeq 4000 - リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 100 bp
- 表現型データの有無
- あり