データセット ID
JGAD000474
- データの種類
- NGS（WGS）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 3.3 TB
- ファイル形式
- FASTQ
- VCF
- BEDPE
- 研究
- hum0094
- 公開日
- 2021-10-12
- 更新日
- 2021-10-12
- DDBJ Search
- JGAD000474 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000360 (新しいタブで開きます)
解析手法
WGS
- 材料と対象者
- 肺腺がん（ICD10：C34）：7症例
非腫瘍組織と腫瘍組織ペア3症例、腫瘍組織のみ4症例
MSI-H大腸がん（ICD10：C18, C19, C20）：12症例
全て非腫瘍組織と腫瘍組織ペア
トリプルネガティブ乳がん（ICD10：C50）：11症例
全て腫瘍組織のみ - 健康状態罹患
- 対象者数30 (人数)
- 疾患
- 肺腺がん
- MSI-H大腸がん
- トリプルネガティブ乳がん
- 試料説明
- 肺がん、大腸がん、乳がんの腫瘍組織および非腫瘍組織から抽出したDNA
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- WGS
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- Chromium Genome Library Kit
- 断片化
- 10x Genomics Chromium Genome Sequencing Solution
- プラットフォーム
- 10x Genomics Chromium
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 125 bp
- 参照ゲノム
- GRCh38