データセット ID
JGAD000402
- データの種類
- NGS（Exome、RNA-seq）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 80.7 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0269
- 公開日
- 2021-05-24
- 更新日
- 2021-05-24
- DDBJ Search
- JGAD000402 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000295 (新しいタブで開きます)
解析手法
WES
- 材料と対象者
- 遺伝性心血管疾患（ICD10：I42）：10＋20症例
- 健康状態罹患
- 対象者数30 (人数)
- 疾患
- 遺伝性心血管疾患 (I42)
- 試料説明
- 末梢血から抽出したDNA
- 組織末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- WES
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- SureSelect Human All Exon V6
- 断片化
- 超音波断片化（Covaris）
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 3000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 100 bp
RNA-seq
- 材料と対象者
- 遺伝性心血管疾患（ICD10：I42）：3症例
- 健康状態罹患
- 対象者数3 (人数)
- 疾患
- 遺伝性心血管疾患 (I42)
- 試料説明
- 心臓移植時の心筋サンプルから抽出したRNA
- 組織心臓
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- RNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- TruSeq Stranded mRNA Library Prep Kit
- 断片化
- 超音波断片化（Covaris）
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2500
Illumina HiSeq 3000 - リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 100 bp