データセット ID
JGAD000401
- データの種類
- NGS（RNA-seq）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 63.6 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0274
- 公開日
- 2022-04-14
- 更新日
- 2022-04-14
- DDBJ Search
- JGAD000401 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000294 (新しいタブで開きます)
解析手法
RNA-seq
- 材料と対象者
- 目的遺伝子KD後のHeLa細胞：20検体
Control KD＋LeptomycinB（LMB：CRM1阻害剤）処理有無の核と細胞質（duplicate）計8検体
NXF1 KDの核と細胞質（duplicate）計4検体
MTR4 KD＋LMB処理有無の核と細胞質（duplicate）計8検体 - 対象者数20 (検体数)
- 性別女性
- 試料説明
- 目的遺伝子KD後のHeLa細胞を核と細胞質に分画し、抽出したRNA
- 腫瘍 / 非腫瘍腫瘍
- 細胞株
- HeLa
- 試料の入手元
- HeLa （ATCCより購入）
- 実験方法
- RNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- TruSeq Stranded mRNA Library Prep Kit
- 断片化
- N/A
- プラットフォーム
- Illumina NovaSeq 6000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 150 bp