研究 ID
hum0274-v1リリース情報
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研究題目
mRNA輸送因子UAP56とURH49による選択的mRNA輸送基盤の統合的解析
研究概要
- 目的
- mRNAの核外輸送はmRNA輸送体によって担われており、ヒトにおいてはNXF1とCRM1がmRNAの輸送に機能する。しかし両者が異なるmRNA群を輸送するか明らかではない。本研究は、NXF1とCRM1が輸送するmRNA群をゲノムワイドに同定し、NXF1とCRM1によるmRNA輸送の分子機構を明らかにする。
- 研究方法
- 目的遺伝子をノックダウン（knockdown：KD）したHeLa細胞を核と細胞質に分画した後RNAを抽出し、RNA-seq解析を実施した。
- 対象
- 目的遺伝子KD後のHeLa細胞
- URL
- N/A
データセット
| カート | データセット ID | データの種類 | 解析手法 | アクセス制限 | 公開日 |
|---|---|---|---|---|---|
| JGAD000401 | NGS（RNA-seq） |
| 制限公開（Type I） | 2022-04-14 |
提供者
- 研究代表者
- 藤田 賢一
- 所属機関
- 藤田医科大学 総合医科学研究所
研究プロジェクト情報
研究プロジェクト情報はありません。
助成金情報
| 科研費・助成金名 | 研究課題名 | 研究課題番号 |
|---|---|---|
科学研究費助成事業 若手研究 | mRNA輸送因子UAP56とURH49による選択的mRNA輸送基盤の統合的解析 |
|
関連論文
| タイトル | DOI | データセット ID |
|---|---|---|
MPP6 stimulates both RRP6 and DIS3 to degrade a specified subset of MTR4-sensitive substrates in the human nucleus |
制限公開データの利用者一覧
| 研究代表者 | 所属機関 | 国・州名 | 研究題目 | データ利用期間 | データセット ID |
|---|---|---|---|---|---|
| 浜田 道昭 | 浜田研究室, 理工学術院, 早稲田大学 | 日本 | RNA標的創薬データベースの構築 | 2023-01-05 – 2027-10-31 |