データセット ID
JGAD000390
- データの種類
- NGS（RNA-seq）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 206 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0267
- 公開日
- 2025-02-17
- 更新日
- 2025-02-17
- DDBJ Search
- JGAD000390 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000284 (新しいタブで開きます)
解析手法
RNA-seq
- 材料と対象者
- 肉腫が疑われた小児（ICD10）：47症例
横紋筋肉腫（C499）19例、Ewing肉腫（C419）8例、未分化肉腫（C499）5例、悪性ラブドイド腫瘍（C809）3例、上衣腫（C719）2例、腎明細胞肉腫（C64）、胎児性横紋筋型腎芽腫（C64）、炎症性筋線維芽細胞性腫瘍（-）、ランゲルハンス細胞組織球症（C966）、脂肪肉腫（C499）、悪性末梢神経鞘腫（C479）、神経芽腫（C749）、NUT carcinoma（C80.9）、皮下脂肪識炎様T細胞リンパ腫（C863）、滑膜肉腫（C499）各1例 - 健康状態罹患
- 対象者数47 (人数)
- 年齢層小児
- 疾患
- 横紋筋肉腫 (C499)
Ewing肉腫 (C419)
未分化肉腫 (C499)
悪性ラブドイド腫瘍 (C809)
上衣腫 (C719)
腎明細胞肉腫 (C64)
胎児性横紋筋型腎芽腫 (C64)
ランゲルハンス細胞組織球症 (C966)
脂肪肉腫 (C499)
悪性末梢神経鞘腫 (C479)
神経芽腫 (C749)
NUT carcinoma (C809)
皮下脂肪識炎様T細胞リンパ腫 (C863)
滑膜肉腫 (C499) - 試料説明
- 腫瘍組織から抽出したRNA
- 腫瘍 / 非腫瘍腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- RNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- NEBNext Ultra RNA Library Prep Kit for Illumina
- 断片化
- 酵素反応
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2500
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 75 bp