データセット ID
JGAD000205
- データの種類
- NGS(Exome)
- アクセス制限
- 制限公開(Type I)
- 総データ量
- 34.9 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- BAM
- 研究
- hum0139
- 公開日
- 2020-09-28
- 更新日
- 2020-09-28
- DDBJ Search
- JGAD000205 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000136 (新しいタブで開きます)
解析手法
WES
- 材料と対象者
- 1症例のRALD患者(ICD10:D763)骨髓細胞より樹立したiPS細胞クローン
KRAS変異株:1検体
対照健常株:1検体 - 健康状態罹患
- 対象者数2 (検体数)
- 疾患
- RALD患者
- 試料説明
- iPS細胞クローンから抽出したDNA
- 組織骨髄
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 細胞株
- iPSC
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- WES
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- SureSelect Human All Exon V5
- 断片化
- SureSelect QXT Human All Exon V5:酵素反応を用いた断片化(トランスポゼース)
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 1500
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 100 bp
- 参照ゲノム
- GRCh37