データセット ID
JGAD000125
- データの種類
- NGS(Exome)
- アクセス制限
- 制限公開(Type I)
- 総データ量
- 522 GB
- ファイル形式
- BAM
- 研究
- hum0070
- 公開日
- 2020-09-28
- 更新日
- 2020-11-18
- DDBJ Search
- JGAD000125 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000115 (新しいタブで開きます)
解析手法
WES
- 材料と対象者
- バート・ホッグ・デュベ症候群:15症例
腎臓がん腫瘍組織29検体、及び非腫瘍組織(正常腎組織)15検体 - 健康状態混在
- 対象者数44 (検体数)
- 試料説明
- 腎臓がん腫瘍組織及び非腫瘍組織(正常腎組織)から抽出したDNA
- 組織腎臓
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- WES
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- SureSelect Human All Exon V5 + lincRNA
- 断片化
- 超音波断片化(Covaris S1)
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 100 bp
- 参照ゲノム
- GRCh37
- 表現型データの有無
- あり