データセット ID
JGAD000027
- データの種類
- NGS(ChIP-seq)
- アクセス制限
- 制限公開(Type I)
- 総データ量
- 95.4 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- XLSX
- 研究
- hum0032
- 公開日
- 2020-09-28
- 更新日
- 2020-11-18
- DDBJ Search
- JGAD000027 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000027 (新しいタブで開きます)
解析手法
ChIP-seq
- 材料と対象者
- 肝部分切除術検体から純化した肝細胞 8種類(正常6検体、B型肝炎ウィルス感染陽性1検体、C型肝炎ウィルス感染陽性1検体)
- 健康状態混在
- 対象者数8 (検体数)
- 試料説明
- 肝部分切除術検体から純化した肝細胞
- 組織Hepatocyte
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- ChIP-seq
- 測定対象
- N/A
- 断片化
- 超音波断片化(BRANSON SLPe, amplitude 40%, on 30 sec and off 30 sec, 10 cycles, on ice)
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2000
Illumina HiSeq 2500 - リードタイプ
- シングルエンド
- リード長
- 36 bp