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NBDC ヒトデータベース

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システムメンテナンスに伴い、以下の日程で、NBDCヒトデータベース申請システムならびにヒトデータ審査委員会による審査が停止いたします。
停止期間：2026年10月5日(月) 9:00 ～ 10月7日(水) 15:00
ご迷惑をおかけしますが、どうぞ宜しくお願いいたします。

現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです

2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所（NIG）バイオデータ研究拠点（BSI）ライフサイエンス統合データベース部門（DBCLS）」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします

研究 ID

hum0032-v1リリース情報

最新

研究題目

ヒト消化器ならびに泌尿器上皮細胞の標準エピゲノム解析（HPCシリーズ）

研究概要

目的
国際ヒトエピゲノムコンソーシアム（The International Human Epigenome Consortium: IHEC）に参画し、年齢・性別の異なる複数の日本人検体から得られた正常細胞等の高品質な標準エピゲノムプロファイルを取得し、データを広く公開して研究基盤形成に貢献する。
研究方法
肝部分切除術検体から純化した肝細胞を対象とするPBAT-seq解析、ChIP-seq解析、RNA-seq解析
対象
肝部分切除術検体から純化した肝細胞 8種類（正常：6例、B型肝炎ウイルス感染陽性：1症例、C型肝炎ウイルス感染陽性：1症例）
URL
N/A

データセット

カートデータセット IDデータの種類解析手法アクセス制限公開日
JGAD000026NGS（PBAT-seq）
  • PBAT-seq
制限公開（Type I）2020-09-28
JGAD000027NGS（ChIP-seq）
  • ChIP-seq
制限公開（Type I）2020-09-28
JGAD000028NGS（RNA-seq）
  • RNA-seq
制限公開（Type I）2020-09-28

提供者

研究代表者
金井 弥栄
所属機関
慶應義塾大学医学部病理学教室

研究プロジェクト情報

研究プロジェクト名URL
革新的先端研究開発支援事業（AMED-CREST） 国際ヒトエピゲノムコンソーシアム（IHEC）金井チーム

助成金情報

科研費・助成金名研究課題名研究課題番号
日本医療研究開発機構 革新的先端研究開発支援事業（AMED-CREST）
「エピゲノム研究に基づく診断・治療へ向けた新技術の創出」領域
N/A

関連論文

タイトルDOIデータセット ID
Amplification-free whole-genome bisulfite sequencing by post-bisulfite adaptor tagging.
https://doi.org/10.1093/nar/gks454 (新しいタブで開きます)
Multilayer-omics analyses of human cancers: exploration of biomarkers and drug targets based on the activities of the International Human Epigenome Consortium.
https://doi.org/10.3389/fgene.2014.00024 (新しいタブで開きます)
N/A

制限公開データの利用者一覧

研究代表者所属機関国・州名研究題目データ利用期間データセット ID
Guillaume BourqueMcGill University & Genome Quebec Innovation Center, McGill Universityカナダ (ケベック州)Epigenome Meta-Analysis Project (epiMAP)2018-06-07 – 2021-03-19
Martin HirstBC Cancer, part of the Provincial Health Services Authorityカナダ (ブリティッシュコロンビア州)Epigenomic analysis of human samples2018-08-06 – 2022-09-05
Quan LongFaculty of Medicine, Department of Biochemistry & Molecular Biology, University of Calgaryカナダ (アルバータ州)Characterizing intrapatient methylome evolution through epihaplotype reconstruction and applied deep learning models.2019-01-21 – 2023-09-21
Quan LongFaculty of Medicine, Department of Biochemistry & Molecular Biology, University of Calgaryカナダ (アルバータ州)Characterizing intrapatient methylome evolution through epihaplotype reconstruction and applied deep learning models.2019-05-13 – 2021-03-19
浜田 道昭浜田研究室, 理工学術院, 早稲田大学日本RNA標的創薬データベースの構築2023-01-05 – 2027-10-31