2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所（NIG）バイオデータ研究拠点（BSI）ライフサイエンス統合データベース部門（DBCLS）」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします
現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです
NBDC ヒトデータベース申請業務ならびにJGA関係の業務につきまして、以下の期間休業いたします：2026年8月12日(水) 〜 2026年8月17日(月) 休業期間中にいただいた申請やお問い合わせ等は、休業明けの 8月18日(火) より順次対応させていただきます。 上記休業期間の前後は通常より対応が遅れることがあります。予めご了承ください。 ご迷惑をおかけいたしますが、ご理解とご協力をお願いいたします。
目的: 国際ヒトエピゲノムコンソーシアム (The International Human Epigenome Consortium: IHEC) に参画し、年齢・性別の異なる複数の日本人検体から得られた正常細胞等の高品質な標準エピゲノムプロファイルを取得し、データを広く公開して研究基盤形成に貢献する。
研究方法: 肝部分切除術検体から純化した肝細胞を対象とするPBAT-seq解析、ChIP-seq解析、RNA-seq解析
対象: 肝部分切除術検体から純化した肝細胞 8種類 (正常: 6例、B型肝炎ウイルス感染陽性: 1症例、C型肝炎ウイルス感染陽性: 1症例)
データセット ID | アクセス制限 | データの種類 | 公開日 | |
|---|---|---|---|---|
| JGAD000026 | 制限公開（Type I） | NGS(PBAT-seq) | 2020-09-28 | |
| JGAD000027 | 制限公開（Type I） | NGS(ChIP-seq) | 2020-09-28 | |
| JGAD000028 | 制限公開（Type I） | NGS(RNA-seq) | 2020-09-28 | |
研究プロジェクト名 | URL |
|---|---|
| 革新的先端研究開発支援事業 (AMED-CREST) 国際ヒトエピゲノムコンソーシアム (IHEC) 金井チーム | https://crest-ihec.jp/index.html |
科研費・助成金名 | タイトル | 研究課題番号 |
|---|---|---|
| 日本医療研究開発機構 革新的先端研究開発支援事業 (AMED-CREST) | 「エピゲノム研究に基づく診断・治療へ向けた新技術の創出」領域 | |
タイトル | DOI | データセット |
|---|---|---|
| Amplification-free whole-genome bisulfite sequencing by post-bisulfite adaptor tagging. | https://doi.org/10.1093/nar/gks454 | |
| Multilayer-omics analyses of human cancers: exploration of biomarkers and drug targets based on the activities of the International Human Epigenome Consortium. | https://doi.org/10.3389/fgene.2014.00024 | |
研究代表者 | 所属機関 | 国・州名 | 研究題目 | データ利用期間 | 利用データID |
|---|---|---|---|---|---|
| Bourque Guillaume | McGill University | Canada | Epigenome Meta-Analysis Project (epiMAP) | 2018-06-07—2021-03-19 | |
| 浜田道昭 | Waseda University | Japan | RNA標的創薬データベースの構築 | 2023-01-05—2027-10-31 | |
| Hirst Martin | BC Cancer, part of the Provincial Health Services Authority | Canada | Epigenomic analysis of human samples | 2018-08-06—2022-09-05 | |
| Long Quan | University of Calgary | Canada | Characterizing intrapatient methylome evolution through epihaplotype reconstruction and applied deep learning models. | 2019-01-21—2023-09-21 | |