データセット ID

E-GEAD-745

Name: E-GEAD-745: NGS（Micro-C and Region Capture Micro-C）、NGS（CITE-seq and 5' single-cell RNA-seq）、NGS（5' and 3' single-cell RNA-seq）、NGS（Multimodal assay including single-nucleus ATAC-seq, 3' and 5' single-nucleus RNA-seq, and 5' single-cell RNA-seq）、NGS（MAS-seq）、NGS（CAGE-seq and NET-CAGE-seq）
Published: 2024-05-14

データの種類: NGS（Micro-C and Region Capture Micro-C）
NGS（CITE-seq and 5' single-cell RNA-seq）
NGS（5' and 3' single-cell RNA-seq）
NGS（Multimodal assay including single-nucleus ATAC-seq, 3' and 5' single-nucleus RNA-seq, and 5' single-cell RNA-seq）
NGS（MAS-seq）
NGS（CAGE-seq and NET-CAGE-seq）
アクセス制限: 非制限公開
総データ量: 14.9 MB
ファイル形式: GTF
TXT
研究: hum0350
公開日: 2024-05-14
更新日: 2024-06-26
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解析手法

MAS-seq

材料と対象者: 日本人健常者：1名
CD4陽性T細胞：2検体; 健康状態
健常
対象者数
1 (人数)
対象集団
日本人
試料説明: 全血から分離したCD4陽性T細胞から抽出したpolyA RNA; 組織
CD4 陽性 T 細胞
腫瘍 / 非腫瘍
非腫瘍
試料の入手元: N/A
実験方法: scRNA-seq
測定対象: N/A
試薬キット: MAS-Seq for 10x Single Cell 3'
断片化: N/A
プラットフォーム: PacBio Sequel II
リードタイプ: ペアエンド
リード長: N/A
参照ゲノム: GRCh38
解析方法: CCS software version 6.3.0、SMRT Link version 12、Stringtie2 version 2.2.1
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