データセット ID
E-GEAD-1107
- データの種類
- NGS（scRNA-seq、scTCR-seq、scCITE-seq）
- アクセス制限
- 非制限公開
- 総データ量
- 355 MB
- ファイル形式
- TXT
- TAR
- 研究
- hum0511
- 公開日
- 2026-07-03
- 更新日
- 2026-08-20
- DDBJ Search
- E-GEAD-1107 (新しいタブで開きます)
解析手法
scRNA-seq
- 材料と対象者
- 健常者28名 (JGAD000957/データセット1)
70～90歳代: 8名
100歳代: 10名
110歳代: 10名 - 健康状態健常
- 対象者数34 (人数)
- 年齢層高齢者
- 試料説明
- 末梢血T細胞から抽出したRNA
- 組織末梢血、T 細胞
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- scRNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- Chromium Next GEM Single Cell 5' v2
- 断片化
- 酵素反応
- プラットフォーム
- MGI DNBSEQ-G400
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 72 bp (Read1)
91 bp (Read2) - 参照ゲノム
- GRCh38
- マッピング
- Cell Ranger 6.1.2
- QC・フィルタリング
- Cell Ranger 6.1.2
- 解析方法
- Cell Ranger 6.1.2
scTCR-seq
- 材料と対象者
- 健常者28名 (JGAD000957/データセット1)
70～90歳代: 8名
100歳代: 10名
110歳代: 10名 - 健康状態健常
- 対象者数34 (人数)
- 年齢層高齢者
- 試料説明
- 末梢血T細胞から抽出したRNA
- 組織末梢血、T 細胞
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- TCR-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- Chromium Single Cell V(D)J Enrichment Kit, Human T Cell
- 断片化
- 酵素反応
- プラットフォーム
- MGI DNBSEQ-G400
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 72 bp (Read1)
91 bp (Read2) - 参照ゲノム
- GRCh38
- マッピング
- Cell Ranger 6.1.2
- QC・フィルタリング
- Cell Ranger 6.1.2
- 解析方法
- Cell Ranger 6.1.2
scCITE-seq
- 材料と対象者
- 健常者28名 (JGAD000957/データセット1)
70～90歳代: 8名
100歳代: 10名
110歳代: 10名 - 健康状態健常
- 対象者数34 (人数)
- 年齢層高齢者
- 試料説明
- 末梢血T細胞から抽出したRNA
- 組織末梢血、T 細胞
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- CITE-seq
- 測定対象
- CD3、CD4、CD8、CD25、CD27、CD28、CD45RA、CD45RO、CD95、TCRD、CCR7、IL7RA、PD-1、CD161、KLRG1、CD56
- 試薬キット
- Chromium Single Cell 5' Feature Barcode Library Kit
- 断片化
- 酵素反応
- プラットフォーム
- MGI DNBSEQ-G400
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 0 bp (Read1)
15 bp (Read2) - 参照ゲノム
- N/A
- マッピング
- Cell Ranger 6.1.2
- QC・フィルタリング
- Cell Ranger 6.1.2
- 解析方法
- Cell Ranger 6.1.2