hum0611-v1リリース情報

造血器疾患患者血液細胞のタンパク質・遺伝子発現の解析

目的

造血器疾患罹患者の血液細胞におけるタンパク質発現や遺伝子発現の解析を行い、特定の疾患における特徴的なタンパク質発現や遺伝子発現の変化を明らかにすること。

研究方法

cDNAライブラリーは、SMART-Seq mRNA法（タカラバイオ）を用いて調製した。増幅された二本鎖cDNAは、AMPure XPビーズ（ベックマン・コールター）を用いて精製した。シーケンシングライブラリーは、Nextera XT DNA Library Prep Kit（イルミナ）およびIDT for Illumina DNA/RNA UDインデックスを用いて作成した。インデックス付きライブラリはPCRにより増幅され、品質管理が行われた。シーケンシングは、慢性GVHDの解析にはIllumina NovaSeq 6000プラットフォームで、フィセチンの解析にはIllumina NovaSeq X Plusプラットフォームを用いて実施され、ペアエンドリードが生成された。

対象

造血器疾患罹患者の血液細胞
1. 慢性移植片対宿主病（Graft-versus-host disease：GVHD）の有無の解析
慢性GVHD有3症例／慢性GVHD無3症例の末梢血、計12検体（CD4+ 6検体、CD8+ 6検体）
2. in vitro Fisetin投与の有無の解析
慢性GVHD 1症例の末梢血4検体（Fisetin投与有CD4+, CD8+、投与無CD4+, CD8+）
※2.の対象者は1.に含まれない

URL

N/A

研究代表者

神保 光児

所属機関

東京大学医科学研究所 造血病態制御学分野

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