データセット ID
JGAD001144
- データの種類
- NGS（RNA-seq）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 117 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0611
- 公開日
- 2026-11-10
- 更新日
- 2026-11-10
- DDBJ Search
- JGAD001144 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000979 (新しいタブで開きます)
解析手法
RNA-seq
- 試料 / 対象者
- 造血器疾患罹患者
- 慢性Graft-versus-host disease（GVHD）有：3症例
- 慢性GVHD無：3症例
末梢血：合計12検体
- CD4+T細胞：6検体
- CD8+T細胞：6検体 - 健康状態罹患
- 対象者数6 (人数)
- 対象集団日本人
- 疾患
- 慢性移植片対宿主病（GVHD）
- 試料説明
- 末梢血より分離したCD4+T細胞およびCD8+T細胞から抽出したRNA
- 組織CD4 陽性 T 細胞、CD8 陽性 T 細胞、末梢血
- 購入試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- RNA-seq
- 対象領域
- N/A
- 試薬キット
- IDT for Illumina DNA/RNA UD Indexes
Nextera XT DNA Library Prep Kit
SMART-Seq mRNA - 断片化
- Tagmentation（Nextera XT DNA Library Prep Kit）
- プラットフォーム
- Illumina NovaSeq 6000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 150 bp
RNA-seq
- 試料 / 対象者
- 慢性GVHD：1症例 合計4検体
- in vitro Fisetin投与有の末梢血より分離したCD4+T細胞およびCD8+T細胞
- in vitro Fisetin投与無の末梢血より分離したCD4+T細胞およびCD8+T細胞 - 健康状態罹患
- 対象者数1 (人数)
- 対象集団日本人
- 疾患
- 慢性移植片対宿主病（GVHD）
- 試料説明
- 末梢血より分離したCD4+T細胞およびCD8+T細胞から抽出したRNA
- 組織CD4 陽性 T 細胞、CD8 陽性 T 細胞、末梢血
- 購入試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- RNA-seq
- 対象領域
- N/A
- 試薬キット
- IDT for Illumina DNA/RNA UD Indexes
Nextera XT DNA Library Prep Kit
SMART-Seq mRNA - 断片化
- Tagmentation（Nextera XT DNA Library Prep Kit）
- プラットフォーム
- Illumina NovaSeq X Plus
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 150 bp