研究 ID
hum0489-v1リリース情報
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研究題目
骨軟部肉腫における遺伝子変異スペクトラムの解析
研究概要
- 目的
- 骨軟部肉腫は難治性の稀少がんである。およそ30%の患者に染色体転座に起因する融合遺伝子形成を認めるが、それ以外の遺伝子変異やゲノム異常に関する理解は進んでいない。本研究では、融合遺伝子陽性骨軟部肉腫の進展・悪性化に重要と考えらえる遺伝子異常を明らかにし、肉腫の病態解析と新たな分子標的治療の開発に資することを目的とする。
- 研究方法
- 全エクソン塩基配列解析、RNA塩基配列解析
- 対象
- ・がん研有明病院において、粘液型脂肪肉腫と診断された患者の外科手術切除検体。
WES：43症例の腫瘍組織43検体
RNA-seq：72症例の腫瘍組織72検体
43症例はWESおよびRNA-seqを実施
・ヒト粘液型脂肪肉腫細胞株（402-91、1955-91、2645-94）
WES：3検体 - URL
- N/A
データセット
| カート | データセット ID | データの種類 | 解析手法 | アクセス制限 | 公開日 |
|---|---|---|---|---|---|
| JGAD000909 | NGS（Exome、RNA-seq） |
| 制限公開（Type I） |
提供者
- 研究代表者
- 植田 幸嗣
- 所属機関
- がん研究会 がんプレシジョン医療研究センター 分析生化学研究部
研究プロジェクト情報
研究プロジェクト情報はありません。
助成金情報
| 科研費・助成金名 | 研究課題名 | 研究課題番号 |
|---|---|---|
科学研究費助成事業 基盤研究（A） | 骨軟部腫瘍における診断マーカーの同定と腫瘍概念の再構築を目指した融合遺伝子の探索 |
|
日本医療研究開発機構（AMED）次世代がん医療創生研究事業（P-CREATE） | ゲノム解析による骨軟部腫瘍の多様性の解明と治療標的・バイオマーカーの探索 |
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関連論文
| タイトル | DOI | データセット ID |
|---|---|---|
Proteogenomic characterization of myxoid liposarcoma reveals molecular features associated with poor prognosis |
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