研究 ID
hum0384-v2リリース情報
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研究題目
造血器腫瘍の分子病態の解明と新規治療薬開発の基盤構築
研究概要
- 目的
- 造血器腫瘍の腫瘍細胞のゲノム・エピゲノム・遺伝子発現解析を行い、腫瘍特異的な遺伝子・エピゲノム・遺伝子発現異常を明らかにすることで、治療標的になりうるか検討する。具体的には、in vitroでの阻害剤投与による抗腫瘍効果の解析や、腫瘍細胞を免疫不全マウスに移植したxenograftモデルを確立し、治療標的の候補となった分子の阻害剤を投与する事でin vivo治療モデルを構築する。最終的には、造血器腫瘍の新規治療薬開発や予後向上に貢献する事を目指す。
- 研究方法
- 造血器腫瘍の確定診断のため採取した骨髄穿刺液の一部を用いる。Ficoll処理により単核球を抽出し、正常細胞の混入を出来るだけ避けるために、MACSビーズもしくはFACS sorterを用いて腫瘍細胞をsortingする。これらの細胞を用いて、遺伝子変異情報を得るために、主要な変異遺伝子のtarget deep sequencingを行うとともに、RNAシークエンスによる遺伝子発現プロファイル解析、およびクロマチン状態と転写制御ネットワークの解析を行うため ATAC-seq によるオープンクロマチン領域の解析を行う。
- 対象
- 共同研究機関(都立駒込病院、文京学院大学、千葉大学附属病院)にて収集した急性骨髄芽球性白血病症例ならびに骨髄異形成症候群症例、および Lonza にて購入した正常細胞
- URL
- N/A
データセット
| カート | データセット ID | データの種類 | 解析手法 | アクセス制限 | 公開日 |
|---|---|---|---|---|---|
| JGAD000732 | NGS(RNA-seq、Target Capture) |
| 制限公開(Type I) | 2024-06-20 | |
| JGAD000851 | NGS(RNA-seq、ATAC-seq) |
| 制限公開(Type I) | 2024-06-20 |
提供者
- 研究代表者
- 岩間 厚志
- 所属機関
- 東京大学 医科学研究所 幹細胞治療研究センター 幹細胞分子医学分野
研究プロジェクト情報
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助成金情報
| 科研費・助成金名 | 研究課題名 | 研究課題番号 |
|---|---|---|
科学研究費助成事業 基盤研究(C) | MDS病態の分子基盤の解明と新規予後予測システムの構築 |
|
科学研究費助成事業 基盤研究(C) | クロマチン特性解析によるMDS分子病態の解明 |
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関連論文
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