データセット ID
JGAD000851
- データの種類
- NGS（RNA-seq、ATAC-seq）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 200 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0384
- 公開日
- 2024-06-20
- 更新日
- 2025-06-30
- DDBJ Search
- JGAD000851 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000718 (新しいタブで開きます)
解析手法
RNA-seq
- 材料と対象者
- 急性骨髄芽球性白血病（ICD10：C92.0）：4症例
Lonzaから購入した正常細胞：2検体 - 健康状態混在
- 対象者数44 (混在)
- 疾患
- 急性骨髄芽球性白血病 (C920)
- 試料説明
- 腫瘍細胞または正常細胞から抽出したRNA
- 組織骨髄
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 実験方法
- RNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- NEBNext Ultra DNA Library Prep Kit for Illumina
SMARTer Ultra Low Input RNA Kit for Sequencing - 断片化
- 超音波断片化
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 1500
Illumina HiSeq 2500 - リードタイプ
- シングルエンド
- リード長
- 60 bp
ATAC-seq
- 材料と対象者
- 急性骨髄芽球性白血病（ICD10：C92.0）：4＋4症例
骨髄異形成症候群（ICD10：D46）：30症例
Lonzaから購入した正常細胞：6検体 - 健康状態混在
- 対象者数44 (混在)
- 疾患
- 急性骨髄芽球性白血病 (C920)
骨髄異形成症候群 (D46) - 試料説明
- 腫瘍細胞または正常細胞から抽出したDNA
- 組織骨髄
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 実験方法
- ATAC-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- NEBNext Ultra DNA Library Prep Kit for Illumina
- 断片化
- Tn5トランスポゼース
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 1500
- リードタイプ
- シングルエンド
- リード長
- 60 bp