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NBDC ヒトデータベース

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研究 ID

hum0357-v5リリース情報

このページは過去のバージョン (v5) です。最新のバージョンは v6 です。
最新バージョン (v6)

研究題目

肺癌の遺伝子発現解析の生物学的特性ならびに診断・治療におけるバイオマーカーの研究

研究概要

目的
呼吸器疾患症例の肺組織を用いたマルチオミックス解析による新規治療方法の解明
研究方法
肺がん症例の腫瘍組織（胸水、喀痰、末梢血、摘出組織、生検）または、腫瘍組織周辺の正常肺組織から樹立したオルガノイドより抽出したDNA/RNAを用いたWhole Genome Sequencing（WGS）、Whole Exome Sequencing（WES）、RNA-seq、scRNA-seq、ATAC-seq、Methylation解析
対象
肺がん43症例43検体（JGAS000557/JGAD000678）＋33症例40検体（JGAS000609/JGAD000738）＋31症例42検体（JGAS000610/JGAD000739）
URL

データセット

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カートデータセット IDデータの種類解析手法アクセス制限公開日
JGAD000678NGS（WGS）
NGS（Exome）
NGS（RNA-seq）
NGS（ATAC-seq）
メチル化アレイ
  • WGS
  • WES
  • RNA-seq
制限公開（Type I）2022-11-02
JGAD000738NGS（Exome）
NGS（RNA-seq）
NGS（ATAC-seq）
  • WES
  • RNA-seq
  • ATAC-seq
制限公開（Type I）2023-08-08
JGAD000739NGS（Exome）
NGS（RNA-seq）
NGS（ATAC-seq）
  • WES
  • RNA-seq
  • scRNA-seq
  • ATAC-seq
制限公開（Type I）2023-08-08

提供者

研究代表者
安田 浩之
所属機関
慶應義塾大学 医学部 呼吸器内科

研究プロジェクト情報

研究プロジェクト情報はありません。

助成金情報

科研費・助成金名研究課題名研究課題番号
日本医療研究開発機構（AMED） 次世代がん医療創生研究事業（P-CREATE）
肺癌オルガノイドライブラリー統合解析による癌の不均一性の解明と新規治療標的同定
  • JP21cm0106576
日本医療研究開発機構（AMED） 革新的がん医療実用化研究事業
肺癌オルガノイドライブラリーを用いた肺癌フェノタイプ多様性を規定する分子基盤解明と新規治療標的同定
  • JP22ck0106722
科学研究費助成事業 基盤研究（B）
肺癌オルガノイドライブラリーを用いた肺癌シグナル経路異常の解明
  • 21H02765
科学研究費助成事業 基盤研究（C）
肺癌オルガノイドライブラリーを用いた新規治療標的の同定
  • 19K08610
科学研究費助成事業 基盤研究（C）
小細胞肺癌オルガノイドを用いた小細胞肺癌発癌過程の理解
  • 22K08290

関連論文

タイトルDOIデータセット ID
Genotype-phenotype mapping of a patient-derived lung cancer organoid biobank identifies NKX2-1-defined Wnt dependency in lung adenocarcinoma
https://doi.org/10.1016/j.celrep.2023.112212 (新しいタブで開きます)
An organoid library unveils subtype-specific IGF-1 dependency via a YAP-AP1 axis in human small cell lung cancer
https://doi.org/10.1038/s43018-025-00945-y (新しいタブで開きます)
Basal-shift transformation leads to EGFR therapy-resistance in human lung adenocarcinoma
https://doi.org/10.1038/s41467-025-59623-3 (新しいタブで開きます)

制限公開データの利用者一覧

研究代表者所属機関国・州名研究題目データ利用期間データセット ID
安田 浩之医学部内科学（呼吸器）, 慶應義塾大学日本肺癌の遺伝子発現解析の生物学的特性ならびに診断・治療におけるバイオマーカーの研究2025-05-20 – 2028-03-31
David OlagnierAarhus UniversityKEAP1 mutation creates a niche for oncovirotherapy by impairing constitute antiviral immunity in lung cancer 2025-12-01 – 2027-01-01