2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所（NIG）バイオデータ研究拠点（BSI）ライフサイエンス統合データベース部門（DBCLS）」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします
現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです
目的: 呼吸器疾患症例の肺組織を用いたマルチオミックス解析による新規治療方法の解明
研究方法: 肺がん症例の腫瘍組織 (胸水、喀痰、末梢血、摘出組織、生検) または、腫瘍組織周辺の正常肺組織から樹立したオルガノイドより抽出したDNA/RNAを用いたWhole Genome Sequencing (WGS) 、Whole Exome Sequencing (WES) 、RNA-seq、scRNA-seq、ATAC-seq、Methylation解析
対象: 肺がん43症例43検体 (JGAS000557/JGAD000678) ＋33症例40検体 (JGAS000609/JGAD000738) ＋31症例42検体 (JGAS000610/JGAD000739)
データセット ID | アクセス制限 | データの種類 | 公開日 | |
|---|---|---|---|---|
| JGAD000678 | 制限公開（Type I） | NGS(WGS) NGS(Exome) NGS(RNA-seq) NGS(ATAC-seq) メチル化アレイ | 2022-11-02 | |
| JGAD000738 | 制限公開（Type I） | NGS(Exome) NGS(RNA-seq) NGS(ATAC-seq) | 2023-08-08 | |
| JGAD000739 | 制限公開（Type I） | NGS(Exome) NGS(RNA-seq) NGS(ATAC-seq) | 2023-08-08 | |
研究プロジェクト名 | URL |
|---|---|
| データなし | |
科研費・助成金名 | タイトル | 研究課題番号 |
|---|---|---|
| 日本医療研究開発機構 (AMED) 次世代がん医療創生研究事業 (P-CREATE) | 肺癌オルガノイドライブラリー統合解析による癌の不均一性の解明と新規治療標的同定 |
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| 日本医療研究開発機構 (AMED) 革新的がん医療実用化研究事業 | 肺癌オルガノイドライブラリーを用いた肺癌フェノタイプ多様性を規定する分子基盤解明と新規治療標的同定 |
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| 科学研究費助成事業 基盤研究 (B) | 肺癌オルガノイドライブラリーを用いた肺癌シグナル経路異常の解明 |
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| 科学研究費助成事業 基盤研究 (C) | 肺癌オルガノイドライブラリーを用いた新規治療標的の同定 |
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| 科学研究費助成事業 基盤研究 (C) | 小細胞肺癌オルガノイドを用いた小細胞肺癌発癌過程の理解 |
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タイトル | DOI | 利用データID |
|---|---|---|
| Genotype-phenotype mapping of a patient-derived lung cancer organoid biobank identifies NKX2-1-defined Wnt dependency in lung adenocarcinoma | https://doi.org/10.1016/j.celrep.2023.112212 | |
| An organoid library unveils subtype-specific IGF-1 dependency via a YAP-AP1 axis in human small cell lung cancer | https://doi.org/10.1038/s43018-025-00945-y | |
| Basal-shift transformation leads to EGFR therapy-resistance in human lung adenocarcinoma | https://doi.org/10.1038/s41467-025-59623-3 | |
研究代表者 | 所属機関 | 国・州名 | 研究題目 | データ利用期間 | 利用データID |
|---|---|---|---|---|---|
| Olagnier David | Aarhus University | KEAP1 mutation creates a niche for oncovirotherapy by impairing constitute antiviral immunity in lung cancer | 2025-12-01—2027-01-01 | ||
| 安田浩之 | Keio University School of Medicine | Japan | 肺癌の遺伝子発現解析の生物学的特性ならびに診断・治療におけるバイオマーカーの研究 | 2025-05-20—2028-03-31 | |