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NBDC ヒトデータベース

カートに入れたデータセットはありません。

システムメンテナンスに伴い、以下の日程で、NBDCヒトデータベース申請システムならびにヒトデータ審査委員会による審査が停止いたします。
停止期間:2026年10月5日(月) 9:00 ~ 10月7日(水) 15:00
ご迷惑をおかけしますが、どうぞ宜しくお願いいたします。

現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです

2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所(NIG)バイオデータ研究拠点(BSI)ライフサイエンス統合データベース部門(DBCLS)」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします

研究 ID

hum0348-v1リリース情報

最新

研究題目

CD30陽性HTLV-1感染細胞のゲノム異常によるATL発症バイオマーカーの同定

研究概要

目的
CD30陽性HTLV-1感染細胞の全ゲノムにわたる染色体構造とエキソーム領域の遺伝子配列を解析し、この細胞集団が高いゲノム不安定性を持つか、さらに、CD30リガンドを介したCD30刺激が染色体構造変異および遺伝子異常を促進するか評価することで、成人T細胞白血病(adult T-cell leukemia-lymphoma:ATL)の発症に関連するバイオマーカーの同定および病態進行のメカニズムの解明を目指す。
研究方法
FACS AriaIIIを用いてCD30発現ATL細胞、CD30非発現ATL細胞、HTLV-1非感染リンパ球を分画後、各分画からDNAを抽出し、whole exome sequencing解析を実施した。併せて、アレイCGH解析により網羅的なDNAコピー数の変化をプロファイリングした。
対象
成人T細胞白血病(ATL):8症例
URL
N/A

データセット

カートデータセット IDデータの種類解析手法アクセス制限公開日
JGAD000656NGS(Exome)
アレイCGH
  • WES
  • アレイ CGH
制限公開(Type I)2023-05-16

提供者

研究代表者
中島 誠
所属機関
東京大学大学院新領域創成科学研究科

研究プロジェクト情報

研究プロジェクト情報はありません。

助成金情報

科研費・助成金名研究課題名研究課題番号
科学研究費助成事業 若手研究
D30陽性HTLV-1感染細胞のゲノム異常によるATL発症バイオマーカーの同定
  • 19K16580
科学研究費助成事業 若手研究
CD30によるROS-DSBを介したゲノム不安定性とATL病態進展機構の解析
  • 22K15420

関連論文

タイトルDOIデータセット ID
The oncogenic driving force of CD30 signaling-induced chromosomal instability in adult T-cell leukemia/lymphoma

制限公開データの利用者一覧

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