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NBDC Research ID:hum0348-v1
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研究題目

CD30陽性HTLV-1感染細胞のゲノム異常によるATL発症バイオマーカーの同定

研究概要

目的: CD30陽性HTLV-1感染細胞の全ゲノムにわたる染色体構造とエキソーム領域の遺伝子配列を解析し、この細胞集団が高いゲノム不安定性を持つか、さらに、CD30リガンドを介したCD30刺激が染色体構造変異および遺伝子異常を促進するか評価することで、成人T細胞白血病 (adult T-cell leukemia-lymphoma: ATL) の発症に関連するバイオマーカーの同定および病態進行のメカニズムの解明を目指す。

研究方法: FACS AriaIIIを用いてCD30発現ATL細胞、CD30非発現ATL細胞、HTLV-1非感染リンパ球を分画後、各分画からDNAを抽出し、whole exome sequencing解析を実施した。併せて、アレイCGH解析により網羅的なDNAコピー数の変化をプロファイリングした。

対象: 成人T細胞白血病 (ATL) : 8症例

データセット一覧

データセット ID
アクセス制限
データの種類
公開日
JGAD000656制限公開(Type I)NGS(Exome) アレイCGH2023-05-16

提供者情報

    研究代表者
    中島 誠
    所属機関
    東京大学大学院新領域創成科学研究科

研究プロジェクト情報

研究プロジェクト名
URL
データなし

助成金情報

科研費・助成金名
タイトル
研究課題番号
科学研究費助成事業 若手研究D30陽性HTLV-1感染細胞のゲノム異常によるATL発症バイオマーカーの同定
  • 19K16580
科学研究費助成事業 若手研究CD30によるROS-DSBを介したゲノム不安定性とATL病態進展機構の解析
  • 22K15420

関連論文

タイトル
DOI
データセット
The oncogenic driving force of CD30 signaling-induced chromosomal instability in adult T-cell leukemia/lymphomahttps://doi.org/10.1111/cas.15706

制限公開データの利用者一覧

研究代表者
所属機関
国・州名
研究題目
データ利用期間
利用データID
データなし