研究 ID
hum0348-v1リリース情報
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研究題目
CD30陽性HTLV-1感染細胞のゲノム異常によるATL発症バイオマーカーの同定
研究概要
- 目的
- CD30陽性HTLV-1感染細胞の全ゲノムにわたる染色体構造とエキソーム領域の遺伝子配列を解析し、この細胞集団が高いゲノム不安定性を持つか、さらに、CD30リガンドを介したCD30刺激が染色体構造変異および遺伝子異常を促進するか評価することで、成人T細胞白血病(adult T-cell leukemia-lymphoma:ATL)の発症に関連するバイオマーカーの同定および病態進行のメカニズムの解明を目指す。
- 研究方法
- FACS AriaIIIを用いてCD30発現ATL細胞、CD30非発現ATL細胞、HTLV-1非感染リンパ球を分画後、各分画からDNAを抽出し、whole exome sequencing解析を実施した。併せて、アレイCGH解析により網羅的なDNAコピー数の変化をプロファイリングした。
- 対象
- 成人T細胞白血病(ATL):8症例
- URL
- N/A
データセット
| カート | データセット ID | データの種類 | 解析手法 | アクセス制限 | 公開日 |
|---|---|---|---|---|---|
| JGAD000656 | NGS(Exome) アレイCGH |
| 制限公開(Type I) | 2023-05-16 |
提供者
- 研究代表者
- 中島 誠
- 所属機関
- 東京大学大学院新領域創成科学研究科
研究プロジェクト情報
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助成金情報
| 科研費・助成金名 | 研究課題名 | 研究課題番号 |
|---|---|---|
科学研究費助成事業 若手研究 | D30陽性HTLV-1感染細胞のゲノム異常によるATL発症バイオマーカーの同定 |
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科学研究費助成事業 若手研究 | CD30によるROS-DSBを介したゲノム不安定性とATL病態進展機構の解析 |
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関連論文
| タイトル | DOI | データセット ID |
|---|---|---|
The oncogenic driving force of CD30 signaling-induced chromosomal instability in adult T-cell leukemia/lymphoma |
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