2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所（NIG）バイオデータ研究拠点（BSI）ライフサイエンス統合データベース部門（DBCLS）」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします
現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです
NBDC ヒトデータベース申請業務ならびにJGA関係の業務につきまして、以下の期間休業いたします：2026年8月12日(水) 〜 2026年8月17日(月) 休業期間中にいただいた申請やお問い合わせ等は、休業明けの 8月18日(火) より順次対応させていただきます。 上記休業期間の前後は通常より対応が遅れることがあります。予めご了承ください。 ご迷惑をおかけいたしますが、ご理解とご協力をお願いいたします。
目的: 次世代シーケンサーを用いた種々の遺伝子解析技術により、KMT2A遺伝子再構成陽性乳児急性リンパ性白血病の発症の原因となる遺伝子異常をゲノムワイドに解析する。
研究方法: 患者の白血病細胞から抽出したDNA/RNAを用いたRNAシーケンス解析・メチル化アレイ解析・エクソームシーケンス解析・シングルセルRNAシーケンス解析、Target Capture シーケンス解析、ならびに、患者由来細胞株検体から抽出したDNA/RNAを用いたChIPシーケンス解析・RNAシーケンス解析を実施。それぞれの解析により得られたデータを統合的に解析した。
対象: 乳児期発症のKMT2A遺伝子再構成陽性急性リンパ性白血病 84症例、および乳児KMT2A遺伝子再構成陽性急性リンパ性白血病由来細胞株 3検体 (84症例とは異なる症例の白血病細胞から樹立)
データセット ID | アクセス制限 | データの種類 | 公開日 | |
|---|---|---|---|---|
| JGAD000500 | 制限公開（Type I） | NGS(Exome) NGS(RNA-seq) NGS(scRNA-seq) NGS(ChIP-seq) メチル化アレイ | 2022-01-14 | |
研究プロジェクト名 | URL |
|---|---|
| データなし | |
科研費・助成金名 | タイトル | 研究課題番号 |
|---|---|---|
| 日本医療研究開発機構 (AMED) 次世代がん医療創生研究事業 (P-CREATE) | 分子プロファイリングを基盤とした小児期からAYA世代に発症する難治がんの新規治療法 の開発 |
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| 科学研究費助成事業 基盤研究 (B) | マルチオミックス情報を基盤とした難治性小児がんに対する新規克服法の開発 |
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| 科学研究費助成事業 基盤研究 (A) | 小児がんにおける遺伝学的高発がん感受性の機序とクローン進化の統合的解析 |
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タイトル | DOI | データセット |
|---|---|---|
| Multi-omics analysis defines highly refractory RAS burdened immature subgroup of infant acute lymphoblastic leukemia | https://doi.org/10.1038/s41467-022-32266-4 | |
名前 | 所属機関 | 国 | 研究題目 | データ利用期間 | データセット一覧 |
|---|---|---|---|---|---|
| 浜田道昭 | Waseda University | Japan | RNA標的創薬データベースの構築 | 2023-01-05—2027-10-31 | |