研究 ID
hum0315-v2リリース情報
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研究題目
造血器腫瘍における遺伝子異常の網羅的解析
研究概要
- 目的
- 次世代シーケンサーを用いた種々の遺伝子解析技術により、KMT2A遺伝子再構成陽性乳児急性リンパ性白血病の発症の原因となる遺伝子異常をゲノムワイドに解析する。
- 研究方法
- 患者の白血病細胞から抽出したDNA/RNAを用いたRNAシーケンス解析・メチル化アレイ解析・エクソームシーケンス解析・シングルセルRNAシーケンス解析、Target Capture シーケンス解析、ならびに、患者由来細胞株検体から抽出したDNA/RNAを用いたChIPシーケンス解析・RNAシーケンス解析を実施。それぞれの解析により得られたデータを統合的に解析した。
- 対象
- 乳児期発症のKMT2A遺伝子再構成陽性急性リンパ性白血病 84症例、および乳児KMT2A遺伝子再構成陽性急性リンパ性白血病由来細胞株 3検体（84症例とは異なる症例の白血病細胞から樹立）
- URL
- N/A
データセット
| カート | データセット ID | データの種類 | 解析手法 | アクセス制限 | 公開日 |
|---|---|---|---|---|---|
| JGAD000500 | NGS（Exome） NGS（RNA-seq） NGS（scRNA-seq） NGS（ChIP-seq） メチル化アレイ |
| 制限公開（Type I） | 2022-01-14 |
提供者
- 研究代表者
- 滝田 順子
- 所属機関
- 京都大学 小児科
研究プロジェクト情報
研究プロジェクト情報はありません。
助成金情報
| 科研費・助成金名 | 研究課題名 | 研究課題番号 |
|---|---|---|
日本医療研究開発機構（AMED） 次世代がん医療創生研究事業（P-CREATE） | 分子プロファイリングを基盤とした小児期からAYA世代に発症する難治がんの新規治療法 の開発 |
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科学研究費助成事業 基盤研究（B） | マルチオミックス情報を基盤とした難治性小児がんに対する新規克服法の開発 |
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科学研究費助成事業 基盤研究（A） | 小児がんにおける遺伝学的高発がん感受性の機序とクローン進化の統合的解析 |
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関連論文
| タイトル | DOI | データセット ID |
|---|---|---|
Multi-omics analysis defines highly refractory RAS burdened immature subgroup of infant acute lymphoblastic leukemia |
制限公開データの利用者一覧
| 研究代表者 | 所属機関 | 国・州名 | 研究題目 | データ利用期間 | データセット ID |
|---|---|---|---|---|---|
| 浜田 道昭 | 浜田研究室, 理工学術院, 早稲田大学 | 日本 | RNA標的創薬データベースの構築 | 2023-01-05 – 2027-10-31 |